计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 15959|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] NPA电荷分析问题

[复制链接 Copy URL]

12

帖子

0

威望

134

eV
积分
146

Level 2 能力者

各位老师:
      在我计算自由配体的NPA电荷,以及配体与金属离子形成配合物之后的NPA电荷时,发现: 形成配合物之后的配位原子的电荷比自由配体中的配位原子的电荷更负,结果如下所示:

配位原子N1配位原子N2配位原子O1
自由配体L-0.506-0.528-0.638
配合物金属离子M2+配位原子N1配位原子N2平衡离子Cl1平衡离子Cl2配位原子O1
Cu-L0.718-0.539-0.54-0.584-0.599-0.634
Ni-L0.727-0.55-0.553-0.56-0.573-0.633
ps:自由配体有三个配位原子分别为N1、N2、O1,配体在与Cu2+/Ni2+发生配位的时候,有两个Cl离子参与配位,形成的都为5配位的配合物。计算使用的泛函为M06,金属离子为SDD基组,其他原子为6-311G(d)基组。
         一般发生配位反应之后,自由配体中的配位原子的电荷应该升高才对吧?为什么我的NPA电荷计算结果会是这样呢?


6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120205

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2018-4-6 00:49:56 | 只看该作者 Only view this author
看看整个配体的电荷怎么变化,别只拘泥于配位原子
另外也可结合其它原子电荷计算方法如ADCH来计算,NPA并非总合理,特别是老版本牵扯过渡金属的时候
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

12

帖子

0

威望

134

eV
积分
146

Level 2 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-4-6 09:18:03 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-4-6 00:49
看看整个配体的电荷怎么变化,别只拘泥于配位原子
另外也可结合其它原子电荷计算方法如ADCH来计算,NPA并 ...

谢谢老师解答,配体的电荷整体上是升高了,可是为什么配位原子的电荷却降低了呢?
我也参照着Multiwfn的手册,计算了ADCH,结果如下:
配体                配位原子N1         配位原子N2  配位原子O1
L                -0.640613         -0.231287            -0.327087
配合物   金属离子M        配位原子N1          配位原子N2        配位原子Cl1   配位原子Cl2    配位原子O1       
Cu-L            0.433316        -0.473819          -0.133139        -0.523948          -0.465441        -0.29803
Ni-L            0.214441        -0.499773          -0.072578        -0.448542          -0.400977        -0.272524
可以发现配位原子的变化是降低的,但是金属离子的规律和NPA电荷的不一样,而事实上,我看有的文献在讲的时候,当配体L选择性Cu优于Ni的时候,一般铜配合物的金属离子的电荷比镍配合物的更低。

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120205

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2018-4-6 15:49:16 | 只看该作者 Only view this author
木易金豆 发表于 2018-4-6 09:18
谢谢老师解答,配体的电荷整体上是升高了,可是为什么配位原子的电荷却降低了呢?
我也参照着Multiwfn的 ...

应当认为是配体的电子给了金属阳离子,或者说,配位原子把电子给了金属阳离子后,配体整体的电荷分布还会重新调节,没有一定必然性配位原子电荷变得更正。

从你的数据上看,ADCH的结果是配位原子电荷变得更正,这很合乎一般化学直觉。不要迷信NPA的结果。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

12

帖子

0

威望

134

eV
积分
146

Level 2 能力者

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-4-8 21:47:23 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-4-6 15:49
应当认为是配体的电子给了金属阳离子,或者说,配位原子把电子给了金属阳离子后,配体整体的电荷分布还会 ...

谢谢老师解答

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-18 07:28 , Processed in 0.222043 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list