计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 14887|回复 Reply: 9
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GAMESS-US] Gamess 赝势只能用于spdfg轨道? —— cc-pvtz-pp基组报错

[复制链接 Copy URL]

239

帖子

0

威望

2340

eV
积分
2579

Level 5 (御坂)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
本帖最后由 brothers 于 2015-1-24 00:11 编辑

因为在gaussian里计算用的是cc基组,所以希望gamess能量分解也在cc基组下完成。


但是在gamess中使用cc-pvtz基组,并为Os指定相应赝势,结果计算停止“THE ECP INTEGRALS ARE LIMITED TO SPDFG CORE POTENTIALS.
这是因为cc-pvtz-pp的赝势部分包含有h轨道成分?为什么Gamess有这种错误?如何解决?

本问题在小木虫上问过,但没人回答。谢谢各位~~现在gamess的使用就卡在这里了......



十室之邑,必有忠信如丘焉,不如丘之好学也。

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120061

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2015-1-23 23:43:14 | 只看该作者 Only view this author
这是因为cc-pVTZ-PP对于Os的赝势定义部分有h角动量,GAMESS-US目前对于ECP积分只能处理到g角动量。

非要用GAMESS-US结合这个基组的话,只能做个近似处理,把h角动量砍掉,此帖第5节有说明
赝势的函数形式以及在量子化学程序中定义的方式
http://sobereva.com/188
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

44

帖子

0

威望

663

eV
积分
707

Level 4 (黑子)

3#
发表于 Post on 2015-1-24 00:15:29 | 只看该作者 Only view this author
如果这个赝势对大于等于h的角动量定义是零,那么砍掉h也没有影响了?
h-ul potential
   1
2      1.00000000             0.00000000

239

帖子

0

威望

2340

eV
积分
2579

Level 5 (御坂)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-1-24 00:16:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-1-23 23:43
这是因为cc-pVTZ-PP对于Os的赝势定义部分有h角动量,GAMESS-US目前对于ECP积分只能处理到g角动量。

非要 ...

非常感谢!!
刚发现原帖内容有错,已经更正
“这是因为cc-pvtz-pp的赝势部分包含有g轨道成分?”更正为“这是因为cc-pvtz-pp的赝势部分包含有h轨道成分?”

麻烦您再帮我看看另一个帖子吧,最近纠结死了.....
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=670
十室之邑,必有忠信如丘焉,不如丘之好学也。

239

帖子

0

威望

2340

eV
积分
2579

Level 5 (御坂)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-1-24 01:05:28 | 只看该作者 Only view this author
成功了。按照http://sobereva.com/188 的讲解,
1、将cc基组的赝势L设为4(仅包含spdfg轨道),并删除h轨道定义部分
2、将g轨道部分的定义剪切下来,放在最前面,像原来的h一样设为0(第二条是1.25日新修正的,最初并未设为0。为什么要设为0,可参考http://bbs.keinsci.com/forum.php ... a=page%3D1&mobile=2)
3、OK~~~
总结下来(并根据sob老师的讲解作了修改)以供以后的同学参考。
ps:
前些天意识到是h轨道的问题时,曾经找了L=4的赝势及相应基组作了计算,比如gamess input中的sbkjc基组,成功了。于是虎虎地就去把cc基组的pp部分的h部分直接删除了,算出来结果有问题....原来是角动量的顺序还有要求~~~受教了~~非常感谢~~
十室之邑,必有忠信如丘焉,不如丘之好学也。

239

帖子

0

威望

2340

eV
积分
2579

Level 5 (御坂)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-1-24 01:14:07 | 只看该作者 Only view this author
jjjspring 发表于 2015-1-24 00:15
如果这个赝势对大于等于h的角动量定义是零,那么砍掉h也没有影响了?
h-ul potential
   1

应该是的吧,数学上为0,删掉理应没有影响~
gamess里算的话,可以找个L<=4并且最高角动量d值为0的试试,比如Cu的赝势就只有spdfg,其中g轨道d值为0.抽空算一个看看,然后再来补充。
回去睡觉了。

还有一个问题亟待解决~~各位大神走过路过不要错过
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=670
十室之邑,必有忠信如丘焉,不如丘之好学也。

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120061

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2015-1-24 02:36:39 | 只看该作者 Only view this author
jjjspring 发表于 2015-1-24 00:15
如果这个赝势对大于等于h的角动量定义是零,那么砍掉h也没有影响了?
h-ul potential
   1

有影响。因为去掉h的话,就得让换g写到前头去,并定义为>=g为0。但是g原先不是0,所以等于g角动量部分没有感受到赝势。但由于角动量很高,造成的影响可能不大。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

239

帖子

0

威望

2340

eV
积分
2579

Level 5 (御坂)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-1-24 13:15:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-1-24 02:36
有影响。因为去掉h的话,就得让换g写到前头去,并定义为>=g为0。但是g原先不是0,所以等于g角动量部分没 ...

sob老师的这条回复让我又产生了一个疑问,就是:
Stuttgart赝势难道必须定义 >=某个L的势为0吗?这有没有数学或物理上的要求?
我昨天的做法是将g的定义直接挪到最上面,也就是对>=g的部分全部使用和g相同的势(不为0),即下面这种形式,计算也能成功。
看了sob老师的回复感觉应该确认一下是否有问题~~谢谢老师~~
  PT-ECP GEN     60     4
  2      ----- g-ul potential     -----
    -11.65174900       2      5.45202000      
    -14.37552500       2      5.41258500      
  2      ----- s-ul potential     -----
    429.64608700       2     14.60450000      
     73.15688400       2      7.21828700      
  4      ----- p-ul potential     -----
     88.02291700       2     11.57716200      
    175.99819600       2     10.88384300      
     13.68227400       2      6.42440300      
     27.41465100       2      5.22419800      
  4      ----- d-ul potential     -----
     43.55785200       2      7.69961000      
     65.36910800       2      7.55080800      
      7.01859600       2      3.96116400      
     11.39173300       2      3.87277700      
  2      ----- f-ul potential     -----
     10.71022000       2      3.37986900      
     14.27812500       2      3.32625500         
  $END
十室之邑,必有忠信如丘焉,不如丘之好学也。

239

帖子

0

威望

2340

eV
积分
2579

Level 5 (御坂)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-1-24 13:19:47 | 只看该作者 Only view this author
brothers 发表于 2015-1-24 13:15
sob老师的这条回复让我又产生了一个疑问,就是:
Stuttgart赝势难道必须定义 >=某个L的势为0吗?这有没 ...

赝势原始形式如下
$ECP
  PT-ECP GEN     60     5
  1      ----- h-ul potential     -----
      0.00000000       2      1.00000000      
  2      ----- s-ul potential     -----
    429.64608700       2     14.60450000      
     73.15688400       2      7.21828700      
  4      ----- p-ul potential     -----
     88.02291700       2     11.57716200      
    175.99819600       2     10.88384300      
     13.68227400       2      6.42440300      
     27.41465100       2      5.22419800      
  4      ----- d-ul potential     -----
     43.55785200       2      7.69961000      
     65.36910800       2      7.55080800      
      7.01859600       2      3.96116400      
     11.39173300       2      3.87277700      
  2      ----- f-ul potential     -----
     10.71022000       2      3.37986900      
     14.27812500       2      3.32625500      
  2      ----- g-ul potential     -----
    -11.65174900       2      5.45202000      
    -14.37552500       2      5.41258500      
  $END
十室之邑,必有忠信如丘焉,不如丘之好学也。

4103

帖子

4

威望

8861

eV
积分
13044

Level 6 (一方通行)

MOKIT开发者

10#
发表于 Post on 2022-4-13 23:57:28 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 zjxitcc 于 2022-4-13 23:59 编辑

发现GAMESS更新了:GAMESS 2021开始已经支持赝势H角动量,无需再做此类修改,直接算就行了。
自动做多参考态计算的程序MOKIT

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-12 21:02 , Processed in 0.514376 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list