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[程序/脚本开发] 高通计算筛选辅助软件PyMSATm

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Level 5 (御坂)

发表于 2018-6-22 23:10:20 | 显示全部楼层 |阅读模式
Python Multipurpose Simulation Analysis Tools Package for MuSiC Software [简写:PyMSATm],PyMSATm软件是一款预处理和结果提取分析软件,主要针对多目的分子模拟程序MuSiC软件编写,目的是在巨正则系综下高通量模拟筛选吸附剂对吸附质微观现象。此程序极大了的方便了在进行高通量计算模拟筛选时所消耗的人工操作时间和复杂度。

主要功能:完成分子模拟前的预处理过程,包括分子建模,力场参数分配,分子电荷计算,可执行文件设定,运行环境设定等功能;并同时批量提交任务满足筛选计算要求;同时完成后期,模拟结果分析、统计和读取功能,包括自动读取模拟结果,导出有效信息,完成数据统计分析等。

此软件为开源软件,欢迎大家试用!如有遇到任何问题请与我们联系:周旭淼 zxm6587101@foxmail.com  杨犁 liyang@wit.edu.cn


PyMSATm1.1.rar

3.08 MB, 下载次数: 99

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发表于 2018-6-22 23:21:38 | 显示全部楼层
手册在压缩包里面,写的很详细,赞一个!

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发表于 2018-6-23 02:27:34 | 显示全部楼层
赞!现在还在用Music的不多了啊,好多都转到Raspa去了

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发表于 2018-6-23 21:40:15 | 显示全部楼层
必须点赞!

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发表于 2018-7-2 13:39:57 | 显示全部楼层
赞,正好最近想做做这方面的工作

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Level 5 (御坂)

发表于 2018-7-2 22:00:47 | 显示全部楼层
工作不错,RASPA也有高通量筛选的功能但是可看的资料太少,用不了。另外提供一点改进意见。1、对每一种吸附质应该做压力与逸度的转换,对于甲烷和氢气这种气体,一般研究其高压吸附性质;2、输出吸附量后应该对每种材料的孔隙率进行计算从而得到超额吸附量,超额吸附量与实验值才有对比价值;3、考虑一下基于RASPA进行高通量筛选的代码编写,RASPA不仅可以直接调用cif文件,还可以在计算时直接解决我提的前两个问题。
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