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[算法与编程] 几何优化、过渡态搜索、IRC综述与原文合集

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发表于 2014-10-26 18:40:02 | 显示全部楼层 |阅读模式
这是几何优化、过渡态搜索、IRC的理论和算法相关的45篇综述与56篇原文合集
http://pan.baidu.com/s/1o69K0YI

几何优化算法、过渡态搜索算法和IRC生成算法在很多文章里是一起讨论的。很多方法如RFO、GDIIS既能用于做几何优化也能搜索过渡态(因为它们都是势能面的驻点)。有点方法只适用或常用于某类计算(量子化学、第一性原理、分子力学),应根据自己的实际情况进行判断。

对于量子化学的初学者,建议先看“综述”文件夹里面的(按照推荐顺序)
Geometry optimization.pdf
Chem6440 Geom.ppt
Chapter 12-Introduction to Computational Chemistry(2ed,Jensen).pdf
Geometry Optimization I(Encyclopedia of Computational Chemistry).pdf
Chapter 5-Molecular modelling Principles and applications(Leach A.R.,2ed).pdf
一些文档里面有一些批注,里面的说法可能有误,无视即可。

另外,过渡态搜索方法最全面的介绍可参见《过渡态、反应路径的计算方法及相关问题》(http://sobereva.com/44)。其中很多讨论完全适用于几何优化。



PS:几何优化不收敛是新人最最最常问的问题之一。我相信,当读者看完了上面推荐的综述,再看了笔者专门写过的帖子《量子化学计算中帮助几何优化收敛的常用方法》(http://sobereva.com/164),就不会再因为这个问题犯难了。

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发表于 2014-11-11 19:39:29 | 显示全部楼层
好帖。。。。。。。。。。。

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发表于 2014-11-12 12:39:08 | 显示全部楼层
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发表于 2014-11-14 23:03:32 | 显示全部楼层
楼主可否搜集整理下关于各密度泛函的相关原文献呢,感觉国内这方面的资料比较少。

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 楼主| 发表于 2014-11-15 01:11:15 | 显示全部楼层
ahehyh 发表于 2014-11-14 23:03
楼主可否搜集整理下关于各密度泛函的相关原文献呢,感觉国内这方面的资料比较少。

泛函实在太多了,而且太杂,虽然平时时不时也收了50多篇,但还远远不够全,就不发了
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发表于 2014-12-27 11:10:24 | 显示全部楼层
好帖子,顶一个~

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发表于 2015-1-8 12:54:51 | 显示全部楼层
谢谢整理并分享自己的劳动成果:lol

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发表于 2015-1-15 17:18:36 | 显示全部楼层
谢谢整理!

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发表于 2015-11-24 18:03:59 | 显示全部楼层
谢谢哦,正在研究这块~~~

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发表于 2016-3-20 21:45:51 | 显示全部楼层
sobereva老师,为什么我下载不了呢?用迅雷下载的时候,一直显示任务失败。

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 楼主| 发表于 2016-3-20 22:15:21 | 显示全部楼层
renleibeth 发表于 2016-3-20 21:45
sobereva老师,为什么我下载不了呢?用迅雷下载的时候,一直显示任务失败。

直接下载,或者用百度云管家,不要用第三方下载工具
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发表于 2016-6-18 16:17:10 | 显示全部楼层
感谢感谢,辛苦!

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发表于 2016-9-14 10:46:57 | 显示全部楼层
谢谢分享

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itccnjuer 发表于 2016-9-15 11:46
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