最新版NAMD的编译安装

fhh2626

1758924310 发表于 2024-4-23 22:20
您好，我是Linux子系统Ubuntu安装NAMD，到了 make -j16这步之后显示

/usr/bin/ld: cannot find -ltcl8.6 ...

没有解压NAMDlib.zip吧

1758924310

fhh2626 发表于 2024-4-24 09:46
没有解压NAMDlib.zip吧

解压了，在NAMD文件夹里有fftw和tcl俩个文件夹，我再重新执行一下？

fhh2626

1758924310 发表于 2024-4-24 10:39
解压了，在NAMD文件夹里有fftw和tcl俩个文件夹，我再重新执行一下？

那就重新./config ....

1758924310

fhh2626 发表于 2024-4-24 10:49
那就重新./config ....

您好，我重新安装了一下，但又出现了如下问题：
charmc: Executing rm -f charmrun
rm -f moduleinit90032.C moduleinit90032.o

请问这个问题该如何解决呢？

生煎小馒头

您好，楼主，我下载的是这个版本的NAMD_3.0.1_Linux-x86_64-multicore-CUDA.tar.gz，为什么我运行./name3会出现这个报错：./namd3: error while loading shared libraries: libmvec.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory，可以帮我解疑一下吗

fhh2626

生煎小馒头 发表于 2024-11-15 19:35
您好，楼主，我下载的是这个版本的NAMD_3.0.1_Linux-x86_64-multicore-CUDA.tar.gz，为什么我运行./name3会 ...

缺少相关的库，可能是机器或者系统太老了吧。可以自己编译

fhh2626

生煎小馒头 发表于 2024-11-15 19:35
您好，楼主，我下载的是这个版本的NAMD_3.0.1_Linux-x86_64-multicore-CUDA.tar.gz，为什么我运行./name3会 ...

缺少相关的库，可能是机器或者系统太老了吧。可以自己编译

hanlan8702

您好，https://www.med.unc.edu/pharm/mi ... /installation_namd/这个链接里面的GaMD的namd patch下载的不是教程里面提供。想请问您这边有吗？谢谢。

fhh2626

hanlan8702 发表于 2025-10-12 19:30
您好，https://www.med.unc.edu/pharm/miaolab/resources/gamd/installation_namd/这个链接里面的GaMD的nam ...

额。。。你认为为什么这个网页要写这句话

hanlan8702

fhh2626 发表于 2025-10-13 11:27
额。。。你认为为什么这个网页要写这句话

额。好吧。我只看到了patch这个。没好好看。谢谢老师。