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[新手求助] Homo与Lumo的密度差分图与电荷密度差分图是一个东西吗?

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最近看了一篇文章,他们做了Homo与Lumo的密度差分图,我也想试着做一下,但是不知道这是不是我们平时说的电荷密度差分图呢?自我感觉两者好像不是一个意思。

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发表于 Post on 2018-9-21 20:39:50 | 只看该作者 Only view this author
仔细看
使用Multiwfn作电子密度差图
http://sobereva.com/113

绘制HOMO和LUMO对应的密度的密度差并没有什么意义,我很不建议效仿此文的做法

真想要考察HOMO和LUMO的重叠程度,应当用Multiwfn,详见此文
使用Multiwfn考察轨道间重叠程度和质心距离
http://sobereva.com/371

灵活利用Multiwfn也可以实现把HOMO和LUMO有重叠的区域绘制出来,比如以等值面的方式绘制衡量不同区域二者交叠程度的sqrt(|psi_HOMO|*|psi_LUMO|)
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-21 20:48:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-9-21 20:39
仔细看
使用Multiwfn作电子密度差图
http://sobereva.com/113

谢谢老师,所以电子密度差分图与HOMO-LUMO重叠程度是不一样的是吗?

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发表于 Post on 2018-9-21 20:53:35 | 只看该作者 Only view this author
DUNING 发表于 2018-9-21 20:48
谢谢老师,所以电子密度差分图与HOMO-LUMO重叠程度是不一样的是吗?

怎么可能一样,完全不同的概念,完全不同的计算方式
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-9-21 21:15:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-9-21 20:53
怎么可能一样,完全不同的概念,完全不同的计算方式

好的,老师,现在我想要绘制这两个轨道的重叠,能否具体说明一下操作呢,本人对Multiwfn的确不熟练,感谢老师的耐心解答

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发表于 Post on 2018-9-21 21:40:09 | 只看该作者 Only view this author
DUNING 发表于 2018-9-21 21:15
好的,老师,现在我想要绘制这两个轨道的重叠,能否具体说明一下操作呢,本人对Multiwfn的确不熟练,感谢 ...

先用Multiwfn分别产生HOMO和LUMO的cube文件,这里提及了
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269

然后用Multiwfn的主功能13中的格点文件运算功能(子功能11)中的操作22,来对这两个cube文件求min(|A|,|B|),即求二者绝对值的最小值,这个函数可以衡量什么地方二者有明显交叠。然后就可以用选项-1来观看新产生的格点数据的等值面了,或者把当前格点数据导出cube文件再用其它程序显示。如果不会用Multiwfn的格点文件运算功能,看Multiwfn手册4.13.2节的例子。
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sobereva 发表于 2018-9-21 20:39
仔细看
使用Multiwfn作电子密度差图
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社长,我还是想绘制HOMO和LUMO的密度差图,请问如何做呢,烦请指点,谢谢!

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发表于 Post on 2019-12-8 18:48:26 | 只看该作者 Only view this author
阿锋001 发表于 2019-12-7 09:39
社长,我还是想绘制HOMO和LUMO的密度差图,请问如何做呢,烦请指点,谢谢!

在Multiwfn里用主功能6的子功能26把HOMO轨道以外的轨道占据数清零,然后照常产生电子密度cube文件(把手册4.5节的例子都做一遍自然就会了),即得到HOMO的密度的cube文件。类似地也产生LUMO的密度的cube文件(LUMO占据数设成和原本的HOMO相同,其它轨道占据数都设0)。之后用主功能13对格点数据求差就完了(把Multiwfn手册4.13节的例子仔细看过一遍,举一反三自然就会了)

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阿锋001 + 3 非常感谢社长,我这就去试试。。。

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