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[Multiwfn资源与经验] Multiwfn绘制平面图的功能已经支持对绘制内容平移和旋转

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发表于 Post on 2018-10-7 01:27:08 | 显示全部楼层 Show all |阅读模式 Reading model
之前经常有人问Multiwfn(http://sobereva.com/multiwfn)的主功能4绘制出来的平面图怎么旋转、怎么平移之类。之前没有平移旋转功能,为了让图像比较正而且感兴趣的区域居中,用户得恰当选择三个原子或者指定三个点来实现,这三个点怎么定义作图平面在手册3.5.2节有明示,但一些空间想象力差的人弄不明白,而且有的用户对于看写得极为清晰易懂的Multiwfn手册是拒绝的。虽然也可以通过ps解决,但一方面麻烦,一方面也没那么完美,毕竟不好处理和坐标轴的对应性。

为了令用户作图能方便地达到满意效果,在2018-Oct-7更新的Multiwfn 3.6(dev)版中加入了对作图内容平移和旋转的功能。例如下面是萘分子的LOL图,通过三个原子来定义了作图平面,图是歪着的,而且不居中
1.png


为了让能让上图摆正、居中。首先我们看一下应该怎么平移。上图的箭头所示的地方是体系中心,是最感兴趣的位置,我们应该让它在图的中央位置。根据坐标轴,我们肉眼可以估计,如果把图整体向Y轴正方向挪动大概2 Bohr就合适了。然后我们再看怎么旋转来摆正,有很多可视化工具都可以预览经过旋转的效果,比如笔者用的Irfanview图像观看程序里面按Ctrl+U就可以调出自定义旋转菜单,可见旋转-62.5度后分子正好摆正了
2.png


因此,我们重新绘制一遍图像,并且在设定作图平面的时候,先选选项-1,输入平移矢量0,2,即X方向不动,Y方向平移2 Bohr。然后输入旋转角度-62.5。
3.png

之后再按照之前的步骤作图,效果如下,可见完全满足我们的期望
4.png

注意这个平移、旋转设定功能仅是对于以模式4、5方式定义作图平面而言的,以其它方式定义作图平面用这个选项无效。

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发表于 Post on 2018-10-10 13:08:27 | 显示全部楼层 Show all
CentOS更新了2018-Oct-7更新的Multiwfn 3.6(dev)版,结果settings.ini找不到了。
现在更新了2018-Oct-10更新的Multiwfn 3.6(dev)版,没有出现上述问题。

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