电子顺磁共振谱（EPR）的计算问题

biogon · 发表于 Post on 2021-7-17 10:34:43

wzkchem5 发表于 2021-7-16 22:54
构象平均也很重要。如果体系只有一个优势构象，DFT就算不准，误差起码应该还比较系统。如果有很多个优势 ...

VPT2算振动平均的EPR参数这个应该也能提高不少精度吧

wzkchem5 · 发表于 Post on 2021-7-17 14:55:14

biogon 发表于 2021-7-17 03:34
VPT2算振动平均的EPR参数这个应该也能提高不少精度吧

嗯对，ORCA 5发布会讲过这个

Scarlett-ww · 发表于 Post on 2022-1-17 17:18:31

wzkchem5 发表于 2021-6-8 15:09
g值，A值，D值，E值；各向同性，各向异性的，都可以算。算出来可以用easyspin画图

请问D值和g值不一样的地方只是比g值多了一个spin-flip项吗？另外，E值是什么呢？实验获取的数据只有g值和A值，ADF也只能计算出g值和A值，这个D值和E值是为了在理论上更准确描述吗？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2022-1-17 18:01:25

Scarlett-ww 发表于 2022-1-17 10:18
请问D值和g值不一样的地方只是比g值多了一个spin-flip项吗？另外，E值是什么呢？实验获取的数据只有g值和 ...

D值和E值是零场分裂参数，只对S>1/2的体系存在，如果你的体系是S=1/2的，那么D和E都是0；如果你的体系是S>1/2的，那么即便实验上也应该把D值和E值拟合出来，不然属于数据没报全。参见https://en.wikipedia.org/wiki/Zero_field_splitting

Scarlett-ww · 发表于 Post on 2022-1-17 22:30:29

wzkchem5 发表于 2022-1-17 18:01
D值和E值是零场分裂参数，只对S>1/2的体系存在，如果你的体系是S=1/2的，那么D和E都是0；如果你的体系是S ...

好的，谢谢，我学习一下

nianbin · 发表于 Post on 2023-5-20 14:48:32

请问下我20几个原子的体系 matlab算了十几天还没有结束这个正常吗

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-5-20 15:47:56

nianbin 发表于 2023-5-20 07:48
请问下我20几个原子的体系 matlab算了十几天还没有结束这个正常吗

手动去掉所有的A值里面较小的、确定不会影响谱图的那些，再试

nianbin · 发表于 Post on 2023-5-20 16:10:47

您的意思是把这些去掉是吧？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-5-20 16:36:17

nianbin 发表于 2023-5-20 09:10
您的意思是把这些去掉是吧？

嗯，从这里去掉也可以，把数据读进matlab再去掉也可以。但是只去掉较小的A值，例如那个-1.77MHz的A值应该是可以去掉的

nianbin · 发表于 Post on 2023-5-20 20:53:09

wzkchem5 发表于 2023-5-20 16:36
嗯，从这里去掉也可以，把数据读进matlab再去掉也可以。但是只去掉较小的A值，例如那个-1.77MHz的A值应该 ...

请问下是就删掉我划线那部分还是说下面的A(iso)连同后面的数值也要删掉

wzkchem5 · 发表于 Post on 2023-5-21 05:33:29

nianbin 发表于 2023-5-20 13:53
请问下是就删掉我划线那部分还是说下面的A(iso)连同后面的数值也要删掉

我没删过property文件，但是总的宗旨就是，把你自己代入easyspin的视角，假如删完以后剩余的部分的格式和原文件格式相同，easyspin看这个文件觉得是orca少算了一些A值，看不出是你手动改的，就行

sigma-jlu · 发表于 Post on 2023-8-3 11:27:05

上周看了几篇Neese组的文献，而且Pantazis曾分享有一个视频，讲orca算epr很透彻，建议看看。

提取码：p55h

总体感觉：

1、只要不是固态体系，首推orca，固态体系目前可以尝试cp2k；

2、easyspin计算跟实验可比拟的谱图之前，需要计算g、A、D张量。

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