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楼主 Author: zdwssg123
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[Gaussian/gview] 高斯算出来的结合能和相互作用能有什么区别

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发表于 Post on 2023-10-2 22:47:36 | 只看该作者 Only view this author
JCenter 发表于 2023-8-31 10:27
老师,如果以上的4点没问题的话,我还有最后1个疑问。
1. 结合能按照约定俗成的都是使用电子能量计算。 ...

考察能不能结合,永远是看结合自由能而非结合能。因为实验上看能不能结合是看结合常数,结合常数和结合自由能直接挂钩(G = -RTlnK),而和结合能没有必然联系。
结合自由能为正,代表结合困难,而不是完全不能结合,所以未必意味着没有必要算相互作用能。例如当A和B的浓度都是1mol/L时只有1%结合,那么结合自由能为正,但是实验上假如就是感兴趣这1%的结合是如何发生的,那么计算相互作用能、能量分解等仍然有意义
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发表于 Post on 2023-10-2 22:48:58 | 只看该作者 Only view this author
大头攒毛 发表于 2023-10-2 15:33
在这里,我也有个疑问。计算结合能:混合物为AB,片段A和片段B拆开后各自计算单点能的时候需要进行opt吗? ...

4楼和6楼已经说了
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发表于 Post on 2023-10-2 22:58:27 | 只看该作者 Only view this author
JCenter 发表于 2023-8-31 17:22
老师,根据该公社群里的有关结合能和相互作用能提问的帖子,再加上阅读了老师您的《谈谈BSSE校正与Gaussi ...

我这两天计算了两个组氨酸衍生物配体和铜离子的配位化合物,发现了很多问题。
“1.假定两个分子A和B在相互远离的状态下(即单独优化并计算单点)分别的电子能量为E_A_1和E_B_1.然后两个分子相互接近,形成AB复合物,将其复合物优化后计算单点,得到其其电子能量为E_AB”。
A和B相互远离时的构型有时候无法确定,有很多种可能,我个人觉得找不完。
“3.A和B间的结合能应该为A和B间的相互作用能与A、B分别的变形能之和,即△E2={E_AB-(E_A_2+E_B_2)}+(E_A_2-E_A_1)+(E_B_2-E_B_1)=E_AB-E_A_1-E_B_1,即复合物的单点能减去A和B相互单独状态下优化的结构的单点能。如果两种分子的变形能均为0,结合能在数值上等于相互作用能。”
我现在认为结合能和形变能没有任何关系,完全是两个概念

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