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[辅助/分析程序] 利用Gaussian结合自写程序计算分子间电荷转移积分

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发表于 2018-11-10 10:56:57 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 让你变成回忆 于 2018-11-10 11:12 编辑

最近自己写了一个利用Gaussian的输出文件,基于格点能修正方式计算转移积分(电子耦合)的程序。

ElecCoupling.py为源程序,PDF包含:基本理论、程序细节、Benchmark等。

PS:这是计算电子耦合最简单的方式,后续会考虑其他稍微复杂的情况(例如:这里并没有考虑轨道的相位)。

_read.so

13.68 KB, 下载次数: 124

Calculation_Electron_Coupling.pdf

253.3 KB, 下载次数: 322

ElecCoupling.py

3.79 KB, 下载次数: 141

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 楼主| 发表于 2018-11-10 11:15:07 | 显示全部楼层
2018-10-10:11:14
更新了一下PDF中的内容。主要讲了下如何利用Gaussian进行计算。

PS:后续如果程序或PDF有更新,均会在下面回帖进行说明。

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发表于 2018-11-10 13:37:08 | 显示全部楼层
Just one doubt about this model: After Lowdin’s orhogonalization transformation, the Pauli repulsion energy between two monomers’ HOMOs (which are originally unorthogoanl) is eliminated. As a consequence, the steric interaction is completely ignored in such analysis.

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发表于 2018-11-13 22:14:31 | 显示全部楼层
楼主如果有window下.dll 的read 就更好了。

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发表于 2019-4-12 16:32:54 | 显示全部楼层
感谢分享。有一个疑惑,如果dimer中有一个分子是三重态,要想计算转移积分,是否可以用此方法。

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发表于 2019-11-1 11:16:55 | 显示全部楼层
大师就是大师

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发表于 2019-11-16 01:57:48 | 显示全部楼层
想问一下,这种方法是不是只能计算二聚体,即两个相同分子之间的电荷转移积分?

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 楼主| 发表于 2019-11-16 10:49:22 | 显示全部楼层
Puying 发表于 2019-11-16 01:57
想问一下,这种方法是不是只能计算二聚体,即两个相同分子之间的电荷转移积分?

两种不同的分子应该也是可以计算的

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发表于 2019-11-17 14:22:11 | 显示全部楼层
让你变成回忆 发表于 2019-11-16 10:49
两种不同的分子应该也是可以计算的

好的,我试一下

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发表于 2020-1-4 15:32:52 | 显示全部楼层
初学python,用python添加了读取矩阵的部分,计算部分都是楼主的

ElecCoupling-2.py

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参与人数 1eV +5 收起 理由
让你变成回忆 + 5 不错,可以不用考虑C写的这个动态库

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发表于 2020-1-6 11:43:18 | 显示全部楼层
本帖最后由 Puying 于 2020-1-6 11:45 编辑
Puying 发表于 2020-1-4 15:32
初学python,用python添加了读取矩阵的部分,计算部分都是楼主的

谢谢楼主!话说楼主晓得FCD或者GMH方法计算电荷转移积分的细节吗?
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