计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 12099|回复 Reply: 3
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 模拟黏度出现负值

[复制链接 Copy URL]

140

帖子

0

威望

1049

eV
积分
1189

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
请问大家,我在模拟一个多肽成胶过程,计算结果出现了一个负值,这个合理吗?怎么处理呢?另外,模拟成胶过程是在水溶液环境中的,计算黏度时需要把水分子除去吗?
Energy                      Average   Err.Est.       RMSD  Tot-Drift
-------------------------------------------------------------------------------
1/Viscosity                -27.3569         11    65.9882   -10.0297  (m s/kg)


生活=做有意义的事

245

帖子

0

威望

2717

eV
积分
2962

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2018-12-14 09:54:00 | 只看该作者 Only view this author
咦,gromacs竟然还可以计算黏度呢。学习了。

140

帖子

0

威望

1049

eV
积分
1189

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-15 09:51:15 | 只看该作者 Only view this author
可以算。
生活=做有意义的事

3

帖子

0

威望

65

eV
积分
68

Level 2 能力者

4#
发表于 Post on 2019-5-7 15:18:52 | 只看该作者 Only view this author
天惹,楼主你现在知道黏度出现负值的意义了吗?刚刚接触不太明白

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-18 04:49 , Processed in 1.797594 second(s), 26 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list