计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 6607|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[NBO相关] Multiwfn导出NBO波函数轨道的问题

[复制链接 Copy URL]

35

帖子

0

威望

192

eV
积分
227

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师好,参照sob老师博文:使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道http://sobereva.com/134
当体系轨道数较多时,出现以下提示,请问NAO的数量在out文件的哪里可以读出,谢谢大家。

Please wait...
Input filename with suffix ranging from .32 to .40 (e.g. ltwd.35)
Note: 32=PNAO 33=NAO 34=PNHO 35=NHO 36=PNBO 37=NBO 38=PNLMO 39=NLMO 40=MO
37
Loading .37 file(NBO)
Expected number of basis functions:      1162

Warning: The number of orbitals is smaller than basis functions! This is becaus
e diffuse functions are used. Please now input the actual number of NAOs (you ca
n easily find it from output of NBO program), e.g. 374

35

帖子

0

威望

192

eV
积分
227

Level 3 能力者

2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-12-31 22:58:14 | 只看该作者 Only view this author
在文件中找到一个最大的orbital数为1136输入,可以继续运算,但是导出的轨道cub文件与实际NBO计算的编号不对等,不知道是不是NAO的number找错导致的,但是输入不同的number,同样的编号仍旧导出同一个不对等的轨道

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120141

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2019-1-1 05:16:11 | 只看该作者 Only view this author
就是这个



不用先导出再看,直接在主功能0里看轨道图形,看是否和NBO输出信息相符。
如果实在弄不明白,可以把文件上传,我仔细看看。

注意求助帖应当在帖子标题明确体现出“提问”、“求助”(见http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html),我已把你的标题改了

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

35

帖子

0

威望

192

eV
积分
227

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-2 10:16:26 | 只看该作者 Only view this author
感谢sob老师的耐心回答,非常不好意思前两天有事不能及时回复。
按照老师说的,我找到了实际的NAO数量,但是在观看过程中发现out文件中编号与轨道编号不符,现将输入,输出文件一并上传,假若老师有空的话,烦请帮忙看看,拜谢。
上传的文件共计有:
1. NBO-data.gjf 计算NBO数据输入文件;
2. NBO-data.out 上述文件的输出文件;
3. NBO-plot.gjf 用于输出轨道文件的输入文件(坐标文件与1中一致);
4. NBO-plot.data 上述文件的输出文件;
5. NBOplot.31 3文件的输出.31文件;
6. NBOplot.37 3文件的输出.37文件。

使用Multiwfn的操作步骤为:
1. Multiwfn读取NBOplot.31文件
2. 37 (之后提示输入实际NAO数量)
3. 查阅NBO-data.out文件后,输入1136(不知道是否找对)
4. 之后0看轨道
5. 以166号轨道为例,在NBO-data.out文件中166号轨道应为LP(1)Br,但是观看却为O处轨道

感谢老师百忙之中抽空帮学生解答,浪费老师时间了

NBO-data.gjf

6.42 KB, 下载次数 Times of downloads: 7

NBO-data.out

1.2 MB, 下载次数 Times of downloads: 2

NBOplot.31

128.13 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

NBO-plot.gjf

6.42 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

NBO-plot.out

1.16 MB, 下载次数 Times of downloads: 1

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120141

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2019-1-2 11:05:25 | 只看该作者 Only view this author
不取俗名 发表于 2019-1-2 10:16
感谢sob老师的耐心回答,非常不好意思前两天有事不能及时回复。
按照老师说的,我找到了实际的NAO数量,但 ...

得把.37一起上传
注意如置顶的新人必读贴和论坛首页的公告栏所示,上传超过500KB的文本型文件上传前必须先压缩再上传,以节约论坛空间、加快下载速度。
弥散函数对NBO轨道和NBO分析结果几乎无可查觉的影响(哪怕是阴离子),完全可以去掉,去掉后就肯定没基函数数目和轨道数目不相同的问题了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

35

帖子

0

威望

192

eV
积分
227

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-2 11:52:12 | 只看该作者 Only view this author
不好意思老师,我可能是传漏了,现已压缩上传;
是的,我现在正在做不加弥散的NBO分析,谢谢老师

NBOplot37.rar

6.34 MB, 下载次数 Times of downloads: 2

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-15 21:53 , Processed in 0.167291 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list