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楼主 Author: sobereva
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[VASP] VASP的最简单的安装方法(含全程视频演示)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-15 09:56:38 | 只看该作者 Only view this author
kaypu 发表于 2019-4-2 17:07
sob老师,您好,目前用vasp计算任务,log文件中显示
************************************************* ...

可以把输入文件发上来我测试下
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-4-16 16:47:38 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 kaypu 于 2019-5-29 10:01 编辑
kaypu 发表于 2019-4-2 17:07
sob老师,您好,目前用vasp计算任务,log文件中显示
************************************************* ...

目前已经编译成功,上面出现的这个问题感觉跟自己的服务器有关系(不确定)。目前采用的是视频sob老师提供的方法,intel编译器用的是2019的update3版本,mkl库也是用的intel的,只不过用的不是intel mpi,而是用的mpich3.3版本的mpi
makefile文件中 FC 和FCL修改成mpich的路径
***************************************************************
FC         = /home/zwk/mpich-install/bin/mpif90
FCL        = /home/zwk/mpich-install/bin/mpif90 -mkl=sequential -lstdc++
*****************************************************************
mkl用的依然是intel的
************************************************************
MKLROOT    =/home/zwk/intel/mkl
MKL_PATH   = $(MKLROOT)/lib/intel64
**********************************************************附件是makefile文件

makefile.include--修改版

2.46 KB, 下载次数 Times of downloads: 20

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发表于 Post on 2019-4-18 10:45:20 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师

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发表于 Post on 2019-4-21 16:15:22 | 只看该作者 Only view this author
感谢社长,本人小白一个,纯实验组没有一个搞计算的,看了社长的视频,安了双系统,并且centOS下vasp安装成功,测试可以使用,用win版castep两年了,终于可以玩玩vasp了。明年去北京第一年,希望可以听到社长讲解第一性原理的课程。万分感谢!!!!!

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发表于 Post on 2019-4-22 18:15:43 | 只看该作者 Only view this author
不知道社长有没有测试过VASP的GPU加速怎么样,能否加入GPU版本的编译方法。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-23 01:41:06 | 只看该作者 Only view this author
devil_lei 发表于 2019-4-22 18:15
不知道社长有没有测试过VASP的GPU加速怎么样,能否加入GPU版本的编译方法。

手头没像样的GPU,没法测试
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发表于 Post on 2019-4-24 22:23:19 | 只看该作者 Only view this author
说起来新版的VASP是真的好编译,在树莓派上用gnu编译器都能整出来,不过得改改makefile,看报错补库。
我需要一些假日,但我不希望每天都是假日。因为我没有承担痛苦,因为那不是真正的自由。

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发表于 Post on 2019-4-25 03:40:41 | 只看该作者 Only view this author
感谢此贴,使用了几周,一切顺利。但是目前遇到了一个问题,我加入vaspsol后,其他都好,但是计算Ra重原子时出现了错误提示 三个:1) WARNING:Sub-space-Matrix is not hermitian in DAV.... 2) very serious problems the old and the new charge density differ; 3)error EDDDAV: call to ZHEGV failed Return code = 7 1 8.网上搜索了很多,都解决不了。看起来似乎只有INTEL 编译出问题,咨询官方,官方提示可能是LAPACK有问题。可否请站长老师传以下你的make.include file?

thanks a lot!

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发表于 Post on 2019-4-25 09:00:31 | 只看该作者 Only view this author
# Precompiler options
CPP_OPTIONS= -DHOST=\"LinuxIFC\"\
             -DMPI -DMPI_BLOCK=8000 \
             -Duse_collective \
             -DscaLAPACK \
             -DCACHE_SIZE=4000 \
             -Davoidalloc \
             -Duse_bse_te \
             -Dtbdyn \
             -Duse_shmem \
             -Dsol_compat

CPP        = fpp -f_com=no -free -w0  $*$(FUFFIX) $*$(SUFFIX) $(CPP_OPTIONS)

FC         = mpiifort
FCL        = mpiifort -mkl=sequential -lstdc++

FREE       = -free -names lowercase

FFLAGS     = -assume byterecl -w
OFLAG      = -O2 -xhost
OFLAG_IN   = $(OFLAG)
DEBUG      = -O0

MKL_PATH   = $(MKLROOT)/lib/intel64
BLAS       =
LAPACK     =
BLACS      = -lmkl_blacs_intelmpi_lp64
SCALAPACK  = $(MKL_PATH)/libmkl_scalapack_lp64.a $(BLACS)

OBJECTS    = fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o fftw3d.o \
             $(MKLROOT)/interfaces/fftw3xf/libfftw3xf_intel.a

INCS       =-I$(MKLROOT)/include/fftw

LLIBS      = $(SCALAPACK) $(LAPACK) $(BLAS)


OBJECTS_O1 += fftw3d.o fftmpi.o fftmpiw.o
OBJECTS_O2 += fft3dlib.o

# For what used to be vasp.5.lib
CPP_LIB    = $(CPP)
FC_LIB     = $(FC)
CC_LIB     = icc
CFLAGS_LIB = -O
FFLAGS_LIB = -O1
FREE_LIB   = $(FREE)

OBJECTS_LIB= linpack_double.o getshmem.o

# For the parser library
CXX_PARS   = icpc

LIBS       += parser
LLIBS      += -Lparser -lparser -lstdc++

# Normally no need to change this
SRCDIR     = ../../src
BINDIR     = ../../bin

#================================================
# GPU Stuff

CPP_GPU    = -DCUDA_GPU -DRPROMU_CPROJ_OVERLAP -DUSE_PINNED_MEMORY -DCUFFT_MIN=28 -UscaLAPACK

OBJECTS_GPU = fftmpiw.o fftmpi_map.o fft3dlib.o fftw3d_gpu.o fftmpiw_gpu.o

CC         = icc
CXX        = icpc
CFLAGS     = -fPIC -DADD_ -Wall -openmp -DMAGMA_WITH_MKL -DMAGMA_SETAFFINITY -DGPUSHMEM=300 -DHAVE_CUBLAS

CUDA_ROOT  ?= /usr/local/cuda/
NVCC       := $(CUDA_ROOT)/bin/nvcc -ccbin=icc
CUDA_LIB   := -L$(CUDA_ROOT)/lib64 -lnvToolsExt -lcudart -lcuda -lcufft -lcublas

GENCODE_ARCH    := -gencode=arch=compute_30,code=\"sm_30,compute_30\" \
                   -gencode=arch=compute_35,code=\"sm_35,compute_35\" \
                   -gencode=arch=compute_60,code=\"sm_60,compute_60\"

MPI_INC    = $(I_MPI_ROOT)/include64/


以上是我的make file

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-25 12:26:35 | 只看该作者 Only view this author
shiqiantao 发表于 2019-4-25 03:40
感谢此贴,使用了几周,一切顺利。但是目前遇到了一个问题,我加入vaspsol后,其他都好,但是计算Ra重原子 ...

makefile.include (2.06 KB, 下载次数 Times of downloads: 66)
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发表于 Post on 2019-4-26 01:45:22 | 只看该作者 Only view this author

感谢Sobereva!
我看到make file 里面 BLAS 以及LAPACK 后面都是空白,看到官方也是如此,会否因此会有些问题。如果要加的话 应该写一些什么?
多谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-26 02:46:23 | 只看该作者 Only view this author
shiqiantao 发表于 2019-4-26 01:45
感谢Sobereva!
我看到make file 里面 BLAS 以及LAPACK 后面都是空白,看到官方也是如此,会否因此会有 ...

MKL库里本来就已经提供了BLAS库和LAPACK库定义的函数,因此用了MKL就不需要设这些
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发表于 Post on 2019-4-26 02:59:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-4-26 02:46
MKL库里本来就已经提供了BLAS库和LAPACK库定义的函数,因此用了MKL就不需要设这些

多谢!可是为什么我计算中会有那些问题?请问版大有没有安装vaspsol,可否帮我测试一个程序是否可以顺利运行,我重新编译了一遍,算Fe O H As C Pb等原子都没问题,加上这个Ra就有问题。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-26 03:08:31 | 只看该作者 Only view this author
shiqiantao 发表于 2019-4-26 02:59
多谢!可是为什么我计算中会有那些问题?请问版大有没有安装vaspsol,可否帮我测试一个程序是否可以顺利 ...

我没安装VASPsol
你再鼓捣鼓捣,或者换其它ifort版本试试,更老的2017或者更新的(现在2019已经出update 3了)
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发表于 Post on 2019-4-26 03:25:04 | 只看该作者 Only view this author
好的 非常感谢!

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