GROMACS的原生Windows版的编译和安装方法（支持GPU加速）

azero · 发表于 Post on 2021-6-1 12:05:00

PrepareForBuild:
  正在创建目录“x64\Release\release-version-info\”。
  正在创建目录“x64\Release\release-version-info\release-.3F9F699C.tlog\”。
InitializeBuildStatus:
  正在创建“x64\Release\release-version-info\release-.3F9F699C.tlog\unsuccessfulbuild”，因为已指定“AlwaysCreate”。
CustomBuild:
  Generating release version information
  CMake Error at cmake/gmxGenerateVersionInfoRelease.cmake:121 (file):
file failed to open for reading (No such file or directory):

   C:/gromacs-2020/computed_checksum

C:\Program Files (x86)\Microsoft Visual Studio\2017\Community\Common7\IDE\VC\VCTargets\Microsoft.CppCommon.targets(209,
5): error MSB6006: “cmd.exe”已退出，代码为 1。 [C:\gromacs-2020\build\release-version-info.vcxproj]
已完成生成项目“C:\gromacs-2020\build\release-version-info.vcxproj”(默认目标)的操作 - 失败。

求助，编译2020.6版本，这个 C:/gromacs-2020/computed_checksum是什么梗

yuangenyue · 发表于 Post on 2021-8-20 18:58:42

确实要重启一下才行，谢谢大神分享！

hlfancomeon · 发表于 Post on 2021-9-17 16:49:49

非常受用，谢谢社长分享

sun666 · 发表于 Post on 2021-9-27 17:12:19

sobereva 发表于 2019-1-5 09:26
我每次写帖子都是考虑到初学者理解能力的底限来写的，甚至还担心有人不懂都录了视频。但仍然经常有人不能 ...

请问老师gromacs2021版有windows版本吗

sobereva · 发表于 Post on 2021-9-27 19:58:09

sun666 发表于 2021-9-27 17:12
请问老师gromacs2021版有windows版本吗

无

喵星大佬 · 发表于 Post on 2021-10-15 03:39:32

本帖最后由喵星大佬于 2021-10-15 05:53 编辑

在Win下纯CPU跑就用WSL2就好了，速度和直接用Linux几乎没啥差，只不过注意跑的时候目录一定要是Linux的目录，所以其实如果跑MD的话只用Win+WSL2是完全OK的

moxxi · 发表于 Post on 2022-5-14 15:05:13

卢老师，下载您预编译的“2020.6 CUDA GPU加速版，AVX2指令集”解压并按文章设置环境变量后，运行时显示gromacs是modified的版本，而“2019.6 CUDA GPU加速版，AVX指令集”则在同样操作后没有出现这一显示，请问这个是我环境变量设置的问题吗？（我电脑上的CUDA Toolkit版本是v11.7，fftw版本是3.3.8）

sobereva · 发表于 Post on 2022-5-14 16:37:15

moxxi 发表于 2022-5-14 15:05
卢老师，下载您预编译的“2020.6 CUDA GPU加速版，AVX2指令集”解压并按文章设置环境变量后，运行时显示gro ...

不用管这个

moxxi · 发表于 Post on 2022-5-14 18:04:32

sobereva 发表于 2022-5-14 16:37
不用管这个

哦哦，好的，谢谢老师

joke122 · 发表于 Post on 2022-9-18 20:13:44

请问老师，win11能否安装

sobereva · 发表于 Post on 2022-9-19 00:36:47

joke122 发表于 2022-9-18 20:13
请问老师，win11能否安装

just try

深爱小李 · 发表于 Post on 2022-9-28 16:18:21

2018.8 CPU版，AVX指令集（15 MB）：http://sobereva.com/soft/gmx/gmx2018.8_AVX_win64.rar
2019.6 CUDA GPU加速版，AVX指令集（93 MB）：http://sobereva.com/soft/gmx/gmx2019.6_AVX_CUDA_win64.rar
2020.3 CUDA GPU加速版，AVX指令集（93 MB）：http://sobereva.com/soft/gmx/gmx2020.3_AVX_CUDA_win64.rar
2020.6 CUDA GPU加速版，AVX2指令集（88 MB）：http://sobereva.com/soft/gmx/gmx2020.6_AVX2_CUDA_win64.rar（nVidia显卡驱动需>=471.11版）
请问@sobereva 老师，这三种加速版（尤其最后一种）文中说的是需要N卡才能提供加速还是只有N卡才能正常运行呀，不是N卡的是直接不能用吗，还是只是不能用GPU加速呢？

夏一天 · 发表于 Post on 2022-9-28 19:10:41

希望@sobereva 老师继续补充2021 CUDA GPU加速版、2022 CUDA GPU加速版等win版gromacs，完善win平台gromacs软件

sobereva · 发表于 Post on 2022-9-29 04:28:31

夏一天发表于 2022-9-28 19:10
希望@sobereva 老师继续补充2021 CUDA GPU加速版、2022 CUDA GPU加速版等win版gromacs，完善win平台gromacs ...

新版本gmx在windows下由于编译器兼容性问题不便于编译
用太新的版本也没多大必要

sobereva · 发表于 Post on 2022-9-29 04:31:10

深爱小李发表于 2022-9-28 16:18
2018.8 CPU版，AVX指令集（15 MB）：http://sobereva.com/soft/gmx/gmx2018.8_AVX_win64.rar
2019.6 CUDA ...

有nVidia的GPU（而且不是性能特烂的低端型号）就用这里的CUDA GPU加速版，没有就用CPU版

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