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楼主 Author: sobereva
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[Gaussian/gview] 详谈使用Gaussian做势能面扫描

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-24 22:29:35 | 只看该作者 Only view this author
xxzj 发表于 2019-7-24 14:34
老师,您好,我有一个问题没有理解,就是我如果设计两个X型结构的分子,其中一个分子的给体单元外面进行4个 ...

看不懂
分子的“各向异性”本身的定义也很不明确
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发表于 Post on 2019-12-12 16:42:09 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,想请教您一个问题,因为目前做的体系波函数优化非常困难,所以只能手动设置位置做柔性扫描了。使用的关键词opt=(maxcyc=40,modr),结果出错了L103,但是modr关键词不能和cart同时使用。请问一下应该怎么解决呢?

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发表于 Post on 2019-12-12 19:04:16 | 只看该作者 Only view this author
霜晨月 发表于 2019-4-3 09:50
请教老师一个问题:
Gaussian做柔性扫描时,每一步都是以上一步的结果作为初始结构。
我经常需要同时扫描 ...

xtb可以解决。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-12-15 10:34:57 | 只看该作者 Only view this author
dwdjljd 发表于 2019-12-12 16:42
老师您好,想请教您一个问题,因为目前做的体系波函数优化非常困难,所以只能手动设置位置做柔性扫描了。使 ...

柔性扫描说的是结构优化,和“波函数优化”完全是两码事
提问时不要说l几几几报错,直接说报错提示
柔性扫描时这种情况怎么处理文中已经明确说了,仔细阅读
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发表于 Post on 2019-12-16 09:51:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-12-15 10:34
柔性扫描说的是结构优化,和“波函数优化”完全是两码事
提问时不要说l几几几报错,直接说报错提示
柔 ...

好的!谢谢老师

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发表于 Post on 2020-5-19 09:45:47 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师,大赞

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发表于 Post on 2020-11-18 16:21:11 | 只看该作者 Only view this author
sob老师,请教一个问题,对于具有对称性的分子,以不破坏对称性的方式进行扫描,柔性扫描和刚性扫描时能否一直保持分子点群不变呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-19 05:37:51 | 只看该作者 Only view this author
Novice 发表于 2020-11-18 16:21
sob老师,请教一个问题,对于具有对称性的分子,以不破坏对称性的方式进行扫描,柔性扫描和刚性扫描时能否 ...

刚性扫描你可以通过令特定的内坐标共享被扫描的变量实现
柔性扫描实现这点需要利用GIC实现

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发表于 Post on 2021-9-20 11:42:11 | 只看该作者 Only view this author
老师好,我需要做您在总结部分提到的这种势能面扫描, ,但是基本不懂如何写程序,请问有没有更详细的说明或者其他解决方案?

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发表于 Post on 2021-9-20 12:47:55 | 只看该作者 Only view this author
zhangxy 发表于 2021-9-20 11:42
老师好,我需要做您在总结部分提到的这种势能面扫描,,但是基本不懂如何写程序,请问有没有更详细的说明或 ...

用Excel按列做加减法。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-9-20 13:45:16 | 只看该作者 Only view this author
zhangxy 发表于 2021-9-20 11:42
老师好,我需要做您在总结部分提到的这种势能面扫描,,但是基本不懂如何写程序,请问有没有更详细的说明或 ...

Multiwfn里直接就能对指定片段的坐标按特定矢量进行平移,之后还能导出成xyz文件,仔细看
Multiwfn中非常实用的几何操作和坐标变换功能介绍
http://sobereva.com/610http://bbs.keinsci.com/thread-24674-1-1.html

结合脚本运行还能一次产生一批对应位移不同距离的xyz文件,参考
详谈Multiwfn的命令行方式运行和批量运行的方法
http://sobereva.com/612http://bbs.keinsci.com/thread-24929-1-1.html
之后cat一合并就能得到xyz轨迹文件

比用Excel明显更方便。

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发表于 Post on 2021-9-20 15:00:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-9-20 13:45
Multiwfn里直接就能对指定片段的坐标按特定矢量进行平移,之后还能导出成xyz文件,仔细看
Multiwfn中非 ...

好的,谢谢老师,我去尝试一下。

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发表于 Post on 2022-3-16 13:02:37 | 只看该作者 Only view this author
对于主客体扫描如果步数不多的话,也可用MS去移动,保存成mol再换成gjf文件,用脚本批量计算,分别提取能量作图

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-3-17 03:37:23 | 只看该作者 Only view this author
七尺贱 发表于 2022-3-16 13:02
对于主客体扫描如果步数不多的话,也可用MS去移动,保存成mol再换成gjf文件,用脚本批量计算,分别提取能量 ...

没必要用M$
直接用文中的dimerscan是最简单的
M$对结构操作能做的任何事情GaussView也都能做到,我认为后者还方便得多
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发表于 Post on 2022-3-18 16:42:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-3-17 03:37
没必要用M$
直接用文中的dimerscan是最简单的
M$对结构操作能做的任何事情GaussView也都能做到,我认为 ...

好的老师

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