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[GROMACS] 求助CGenff生成小分子拓扑文件问题

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本帖最后由 mjluan 于 2019-4-15 10:35 编辑

老师您好,我看了您写的CGenff生成小分子拓扑文件的文章,按照您教程里的操作,可是在生成拓扑文件时总是出现这个错误,能否请教一下老师该如何解决

http://sobereva.com/266这是老师的教程

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-12 16:48:59 | 只看该作者 Only view this author
报错信息如下

086W{~2G$SLE(RX8CG_[N)X.jpg (153.03 KB, 下载次数 Times of downloads: 46)

086W{~2G$SLE(RX8CG_[N)X.jpg

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发表于 Post on 2019-4-12 22:24:17 | 只看该作者 Only view this author
问问题的时候别把大段博文原话粘过来,只会造成看帖者混乱
贴那么一大段话还不如直接把我博文链接贴出来、把文件上传便于别人考察
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-4-15 10:31:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 mjluan 于 2019-4-15 11:06 编辑

这是上传的文件,不知道各位大神有没有建议,谢谢

cgenff_charmm2gmx.py

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NAG.mol2

5.19 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

NAG.str

13.09 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

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发表于 Post on 2020-6-12 10:04:24 | 只看该作者 Only view this author
您好,你的问题有解决方法能分享一下嘛,我也遇到同样的问题,多谢

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