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[综合交流] 分子体积计算的问题

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在g09中用volume关键词做一结构的体积计算,出来的结果随scf方法变化而变化,差别还不小。

按照手册,这个体积是MC出来的。求科普,这与scf方法有什么关系

谢谢

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发表于 Post on 2019-5-5 06:36:10 | 只看该作者 Only view this author
仔细看此文
谈谈分子体积的计算
http://sobereva.com/102

volume是通过MC方法求的电子密度等值面内区域的体积,波函数不同,电子密度等值面就不同,体积就不同。
然而,你看到的现象绝非主要来自计算级别的差异,绝大部分原因来自于MC方法自身的随机性。如果你用Multiwfn的主功能12来计算体积(看上文),比volume关键词通过MC方法算体积准确得多,每次计算结果还精确相同,没有任何随机性,你也肯定不会看到仿佛是不同级别下算的结果相差很大的现象。
总之,强烈不建议用volume关键词算体积
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-5 09:16:25 | 只看该作者 Only view this author
多谢社长

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-5 21:02:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-5 06:36
仔细看此文
谈谈分子体积的计算
http://sobereva.com/102

用社长的MT方法,def2svp和def2tzvp出来的结果分别为810和817A3,结果是否正常?

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发表于 Post on 2019-5-6 08:42:17 | 只看该作者 Only view this author
shalene 发表于 2019-5-5 21:02
用社长的MT方法,def2svp和def2tzvp出来的结果分别为810和817A3,结果是否正常?

很正常
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发表于 Post on 2019-12-13 20:32:10 | 只看该作者 Only view this author
我通过用Multiwfn的主功能12计算出来的体积,计算了覆盖率,覆盖率与实验值相差1~2个数量级,覆盖率能否做个校正?

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发表于 Post on 2019-12-15 11:16:02 | 只看该作者 Only view this author
小毛毛 发表于 2019-12-13 20:32
我通过用Multiwfn的主功能12计算出来的体积,计算了覆盖率,覆盖率与实验值相差1~2个数量级,覆盖率能否做 ...

我不晓得覆盖率怎么算的,估计你的计算模型太简单了,缺乏对实际因素的考虑,或者算法本身原理上就有明显问题
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发表于 Post on 2023-5-6 16:38:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-5 06:36
仔细看此文
谈谈分子体积的计算
http://sobereva.com/102

请问社长,如果是离子体积可以通过Multiwfn程序计算么?例如HOO-和EtO-的体积?

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发表于 Post on 2023-5-6 19:04:21 | 只看该作者 Only view this author
PESPES 发表于 2023-5-6 09:38
请问社长,如果是离子体积可以通过Multiwfn程序计算么?例如HOO-和EtO-的体积?

仔细看那篇博文就会知道,sob老师说的计算分子体积的方法,在推导的时候完全没有用到分子不带电的条件。所以这个方法也是适用于离子的,只要你计算离子的理论级别合适(尤其是该加弥散函数的时候必须加)就行了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2023-5-9 08:57:55 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2023-5-6 19:04
仔细看那篇博文就会知道,sob老师说的计算分子体积的方法,在推导的时候完全没有用到分子不带电的条件。 ...

好的,谢谢

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