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楼主 Author: kunkun
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[其它程序] 【教程】Rosetta Remodel: 快速修复PDB中缺失的Loop

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发表于 Post on 2023-2-9 05:47:14 | 只看该作者 Only view this author
tomwong4253 发表于 2019-5-9 21:22
作为结构生物学混出来的摸鱼玩家有个不理解的问题:loop如果在蛋白功能区,那么重要的部位还有缺失,并且缺 ...

因為LOOP flexibility很高..XRAY不容易看到 這不是常識?

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发表于 Post on 2023-2-28 19:44:21 | 只看该作者 Only view this author
想请教一下楼主,蓝图里怎么写可以做到将两个蛋白用linker连接起来呢

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发表于 Post on 2023-3-22 16:20:56 | 只看该作者 Only view this author
tomwong4253 发表于 2019-5-9 21:22
作为结构生物学混出来的摸鱼玩家有个不理解的问题:loop如果在蛋白功能区,那么重要的部位还有缺失,并且缺 ...

通过计算模拟后机制解析清晰是不是可以发啊?我们做计算模拟的不就是为了解释实验上观测不到的黑箱问题么?

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发表于 Post on 2024-9-14 22:44:37 | 只看该作者 Only view this author
PDB如果是蛋白质复合物有多条莲好像会fix的很奇怪,蓝图文件里面无法指定氨基酸链,是不是需要重新将氨基酸残基编号呐?

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