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[Gaussian/gview] 气相中过渡态振荡不收敛

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本帖最后由 夜千 于 2019-5-11 22:02 编辑

方法是M062x,液相中已经找到此过渡态,气相中要么直接是产物,要么非常规律的振荡不收敛。已经按照教程加入了不同的关键词,包括calcall,gdiis,maxstep等,仍然不收敛。请问现在该怎么修改命令呢
这是我的输入文件
# M062x/6-31G(d,p) opt(calcall,maxcycle=200,TS,noeigen) freq=noraman integral=ultrafine temperature=313.15

Title Card Required

0 1
C                  3.61576900   -1.07496700   -0.47556600
C                  3.07262300    0.22416900   -0.29557000
C                  3.93548900    1.31743600   -0.37023500
C                  5.28982900    1.10763200   -0.64393300
C                  5.79382400   -0.17596300   -0.83268700
C                  4.95608800   -1.29151800   -0.74364600
C                  1.38742900   -1.40281900   -0.07171000
H                  3.58620300    2.32948300   -0.20630800
H                  5.95647800    1.96137700   -0.70553100
H                  6.84855600   -0.31685200   -1.04463700
H                  5.34388900   -2.29680200   -0.87472600
N                  2.60797400   -2.01921400   -0.32822400
C                  2.75126900   -3.43623900   -0.53904800
H                  3.39094100   -3.88892800    0.22617200
H                  1.75267900   -3.87088000   -0.48053000
H                  3.18256900   -3.63823100   -1.52509400
O                  0.32366900   -2.01400100    0.06169900
C                 -0.82854000   -1.17041200    2.62301500
C                 -0.09489100   -0.12876400    3.01716900
C                  0.73778100    2.20416200    0.04622400
C                 -0.50731800    2.99518000    0.17787900
F                 -0.24258100    4.27814700    0.43778900
F                 -1.28859800    2.97580700   -0.93366600
F                 -1.31060100    2.53103500    1.16761000
C                  1.66352900    0.02813000   -0.02646700
N                  0.65601900    0.90216800    0.11052500
C                 -1.81669300   -1.08791700    1.54542000
C                 -2.93872100   -1.92081900    1.49746500
C                 -2.50504900    0.00773600   -0.41033700
C                 -3.86149000   -1.77483900    0.47654500
H                 -3.07363000   -2.67199800    2.26633300
C                 -3.63382400   -0.78709500   -0.47372600
H                 -2.28278600    0.77160000   -1.14885500
H                 -4.74686900   -2.39511500    0.39915300
N                 -1.64056200   -0.15997200    0.58614300
N                 -4.58381900   -0.58967100   -1.57050700
O                 -5.54978500   -1.32716700   -1.60303800
O                 -4.33751500    0.29711600   -2.36381000
H                 -0.20587600    0.85436000    2.56944300
H                 -0.74005300   -2.13831600    3.10647000
H                  1.63617500    2.74210800   -0.22224700
H                  0.62691800   -0.23292500    3.81898800
H                 -0.57003200    0.34690000    0.42665900


smd+gas.rar

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液相

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发表于 Post on 2019-5-11 20:44:52 | 只看该作者 Only view this author
震荡不收敛的有优化出一个yes吗?(RMS Force项)感觉可能是气相TS和液相差的比较多所以初结构不合理了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-11 21:49:09 | 只看该作者 Only view this author
Shaoqz 发表于 2019-5-11 20:44
震荡不收敛的有优化出一个yes吗?(RMS Force项)感觉可能是气相TS和液相差的比较多所以初结构不合理了

我所上传的输入文件中没有一个yes,但是如果输入命令改为# M062x/6-31G(d,p) opt(calcfc,maxcycle=200,TS,noeigen,gdiis,maxstep=3,notrust) freq=noraman integral=ultrafine temperature=313.15
就只有RMS有一个yes

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发表于 Post on 2019-5-12 01:05:49 | 只看该作者 Only view this author
夜千 发表于 2019-5-11 21:49
我所上传的输入文件中没有一个yes,但是如果输入命令改为# M062x/6-31G(d,p) opt(calcfc,maxcycle=200,TS ...

有试过把rms force比较小且结构合理的作为新的初结构重投吗

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发表于 Post on 2019-5-12 10:05:31 | 只看该作者 Only view this author
气相下和溶剂模型下势能面可能存在明显不同,未必溶剂下存在的TS在气相下就有,或者可能都有但结构偏离较大。不确定的话可以做势能面扫描辅助判断

写=noraman完全多余
常见的多余的和被滥用的Gaussian关键词
http://sobereva.com/331http://bbs.keinsci.com/thread-3460-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-13 14:43:58 | 只看该作者 Only view this author
Shaoqz 发表于 2019-5-12 01:05
有试过把rms force比较小且结构合理的作为新的初结构重投吗

有,仍然振荡

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-13 20:56:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-12 10:05
气相下和溶剂模型下势能面可能存在明显不同,未必溶剂下存在的TS在气相下就有,或者可能都有但结构偏离较大 ...

谢谢老师,我用B3LYP找到了此过渡态的气相,能否说明他在气相中是存在的呢,只是可能由于M062找过渡态弱一点

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发表于 Post on 2019-5-14 03:26:28 | 只看该作者 Only view this author
夜千 发表于 2019-5-13 20:56
谢谢老师,我用B3LYP找到了此过渡态的气相,能否说明他在气相中是存在的呢,只是可能由于M062找过渡态弱 ...

对有机体系,如果M06-2X找不到,底气不足。至少用其它的靠谱的比如wB97XD也能找到才比较容易说得过去
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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