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[综合交流] 双光子吸收计算求助

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本帖最后由 yuiop 于 2019-7-17 15:43 编辑

各位老师好,最近老师要求计算双光子分子的相关性质,但是本人是新手,组内以前没有过涉及过相关计算,有些问题想请教大家:
1. OPA和TPA吸收光谱的计算:看一些文献上计算方法写的是用gaussian进行TDDFT计算,但是我不太清楚关键词该怎么写。在论坛上搜索了一下,OPA吸收光谱是像普通分子一样计算,直接在S0结构上#p td b3lyp/6-31g(d)吗?双光子的吸收谱又该写哪些关键词?
2. 跃迁偶极矩:请问这是和普通的单光子吸收分子一样计算吗?还有激发态的偶极矩需要优化激发态结构吗?
3. TPA λmax:请问这个用高斯如何计算?而且应该取哪个激发态,我看到文献上不都是S1,是要振子强度不为0就行,还是算很多个态取振子强度最大的,还是其它什么判别方法?
4. 双光子吸收截面:看到一些文献使用dalton计算的,我也查了一下,但是关于输出文件的解读不太会,如下是我在网上下载的一个dalton计算双光子的部分输出文件,请问sigma是双光子吸收截面吗?这里的很多参数都又分为Linear和Circular Polarization,应该取哪个?
麻烦各位坛友和老师指导一下,谢谢大家!
                   +-----------------------------------+
                   |   Two-photon absorption summary   |
                   +-----------------------------------+
   ---------------------------------------------------------------------------------
   Sym  No  Energy  Polarization         Df         Dg          D      sigma       R
   ---------------------------------------------------------------------------------
     1   1    3.08   Linear       0.740E+02  0.829E+02  0.479E+03  0.334E+01    0.73
     1   1    3.08   Circular     0.740E+02  0.829E+02  0.349E+03  0.243E+01    0.73

       Rotationally averaged two-photon transition strengths

                       and rate constants

       +-------------------+----------------+----------------+
       |   Polarization    |    DELTA_TP    |   K (0 -> f)   |
       +-------------------+----------------+----------------+
       |  linear (para)    | 479.48261585   |  0.154302E-18  |
       +-------------------+----------------+----------------+
       |  linear (perp)    | 340.34499908   |  0.109527E-18  |
       +-------------------+----------------+----------------+
       |    circular       | 349.21210845   |  0.112380E-18  |
       +-------------------+----------------+----------------+


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发表于 Post on 2019-6-24 14:41:51 | 只看该作者 Only view this author
我也不是太懂,下面是个人的一些浅显见解,不对的地方请大家批评指正!
1.OPA吸收光谱既可以用Gaussian,也可以用Dalton计算,一般都用Gaussian,具体指令参照sob老师写的《Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法》。
TPA信息只能用Dalton计算,计算的dal文件需要参照手册自己编写,mol文件生成方法:把fch文件拖入Multiwfn,进入主功能100,依次再选2,19.
2.跃迁偶极矩的算法好多帖子都有
3.TPA 我没见过λmax,只有σmax
4.好多老师说文件里直接输出的sigma并不是双光子吸收截面,可以自己编个脚本根据D(微观双光子吸收截面)计算一下σ。Linear和Circular Polarization分别是线偏振和圆偏振,看自己的实验条件做出选择。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-6-24 15:31:30 | 只看该作者 Only view this author
heheda 发表于 2019-6-24 14:41
我也不是太懂,下面是个人的一些浅显见解,不对的地方请大家批评指正!
1.OPA吸收光谱既可以用Gaussian, ...

好的,谢谢您!我再去学习学习。

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发表于 Post on 2019-6-25 04:29:21 | 只看该作者 Only view this author
GAMESS-US也可以做TPA计算,在$TDDFT里添加TPA=.TRUE.即可
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-6-25 09:42:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-6-25 04:29
GAMESS-US也可以做TPA计算,在$TDDFT里添加TPA=.TRUE.即可

好的,谢谢老师!不过我们组里目前只有gaussian和dalton,GAMESS-US没有使用经验,我再去查查相关资料吧。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-12 22:06:03 | 只看该作者 Only view this author
heheda 发表于 2019-6-24 14:41
我也不是太懂,下面是个人的一些浅显见解,不对的地方请大家批评指正!
1.OPA吸收光谱既可以用Gaussian, ...

老师,您好!我最近在重复文献,但是计算结果一直和文献不符,所以想再请教您一下。如下是我用Dalton计算TPA的dal文件:
**DALTON                                          
.RUN RESPONSE                                    
**WAVE FUNCTIONS                                 
.HF                                               
**RESPONSE                                       
*QUADRATIC                                       
.TWO-PHOTON                                       
.ROOTS                                            
10                                                
**END OF INPUT
请您帮忙看下是不是有什么问题。
另外,请问TPA波长是用1240/Energy*2得到的吗?因为我这样能到的和文献一致的TPA波长,但除此之外,无论是delta_TP还是sigma_TP,我计算得到的结果都和文献差很大。您说sigma不是TPA截面,请问如何计算得到双光子吸收截面?谢谢!

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发表于 Post on 2019-7-16 11:14:54 | 只看该作者 Only view this author
yuiop 发表于 2019-7-12 22:06
老师,您好!我最近在重复文献,但是计算结果一直和文献不符,所以想再请教您一下。如下是我用Dalton计算 ...

你把文献DOI号和你的结果文件贴出来吧,单独看dal文件也没啥问题,波长能对应说明应该是对的。后面的不对有可能是你公式理解错了,或者单位没有换算正确。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-17 15:47:26 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 yuiop 于 2019-7-17 15:49 编辑
heheda 发表于 2019-7-16 11:14
你把文献DOI号和你的结果文件贴出来吧,单独看dal文件也没啥问题,波长能对应说明应该是对的。后面的不对 ...

谢谢老师,我重复的是篇04年的中文文献,http://wulixb.iphy.ac.cn/CN/Y2004/V53/I7/2112#
我重复了该文中SB-DD分子的计算,以下是我的计算结果与文献值的对比:
SB-DD        i        ωi (eV)        δtp        λtp (nm)        σtp (GM)
文献        1        4.39        3.15E-02        564        1.48E-05
计算        1        4.39        3.30E+01        565         1.56E-02
文献        2        5.49        6.49E+03        452        4.78E+00
计算        2        5.49        6.48E+03        452         4.78E+00
文献        3        5.5        5.43E-01        452        3.95E-04
计算        3        5.5        1.31E+01        451         9.66E-03
文献        4        5.89        4.91E+04        420        4.16E+01
计算        4        5.88        4.89E+04        422         4.13E+01
文献        5        6.93        3.11E-02        358        3.60E-05
计算        5        6.93        2.18E+01        358         2.56E-02
附件是我计算的SB-DD的dalton输出文件。
我后来也重复了另外2篇文献,结果都和文献一致,不知道是不是因为这篇文献太老了,所以没算出来。麻烦您了!

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发表于 Post on 2019-7-17 20:33:21 | 只看该作者 Only view this author
你的计算和数据处理都是正确的,不要担忧。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-18 08:45:29 | 只看该作者 Only view this author
heheda 发表于 2019-7-17 20:33
你的计算和数据处理都是正确的,不要担忧。

好的,谢谢您,辛苦了!

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发表于 Post on 2019-11-25 19:57:36 | 只看该作者 Only view this author
yuiop 发表于 2019-7-17 15:47
谢谢老师,我重复的是篇04年的中文文献,http://wulixb.iphy.ac.cn/CN/Y2004/V53/I7/2112#
我重复了该文 ...

同学你好,我刚接触理论计算,想问一下对于计算双光子特性的输出文件,你是怎么分析的呢?有没有什么具体说明书啥的?

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发表于 Post on 2021-7-13 16:56:11 | 只看该作者 Only view this author
您好,我想请问一下,双光子吸收有具有的判定条件吗?比如带隙需要介于多少之间,我网上没有找到准确的标准,所以想向您请教一下

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发表于 Post on 2022-1-23 21:31:36 | 只看该作者 Only view this author
你好,看到你双光子吸收的帖子,你现在知道怎样从Dalton输出文件中“Two-photon absorption summary"的数据计算双光子吸收截面吗?不知道能否告知一下,谢谢

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