求助：关于CPMD与AIMD的区别

ZXW1993

granvia 发表于 2019-10-9 19:29
Nope

因为我在这篇jacs（10.1021/jacs.5b13048）文章中看到，作者用AIMD跑出来了一个反应，然后说这个反应是近乎无垒的，所以想请教一下。文章中有这样一句话“Here, we show direct ab initio molecular dynamics (AIMD)
simulation evidence of the near-barrierless formation of ammonium bisulfate (NH4HSO4) from the hydrated NH3 and SO3 molecules.” 文章中使用的是BLYP泛函，在300K温度下模拟的。

文章链接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.5b13048

ZXW1993

granvia 发表于 2019-10-9 19:29
Nope

我在一篇jacs文章中看到这样一句话“Here, we show direct ab initio molecular dynamics (AIMD)
simulation evidence of the near-barrierless formation of ammonium bisulfate (NH4HSO4) from the hydrated NH3 and SO3 molecules.” 作者在300K温度下模拟的。文章中的说法是错误的吗？
文章链接：https://pubs.acs.org/doi/10.1021/jacs.5b13048

granvia

ZXW1993 发表于 2019-10-9 20:18
我在一篇jacs文章中看到这样一句话“Here, we show direct ab initio molecular dynamics (AIMD)
simula ...

没时间看文章。根据化学常识，室温下可以发生的反应很多都是有能垒的。可以根据不同温度下的大量MD模拟结果，推算出活化能的大小（Arrhenius方程）。如果一个反应无能垒，那么在不同温度下的反应速率都应该是差不多的。我觉得应该通过这个方式来验证。

ZXW1993

granvia 发表于 2019-10-10 10:38
没时间看文章。根据化学常识，室温下可以发生的反应很多都是有能垒的。可以根据不同温度下的大量MD模拟结 ...

您说“可以根据不同温度下的大量MD模拟结果，推算出活化能的大小（Arrhenius方程）”，那么模拟的一个反应发生的时间是不是和速率有关系呢？

哐当哐当

granvia 发表于 2019-10-9 17:23
能量包括振动能与势能。一般通过分配振动能来设置起始能量，势能可设为零（即起始几何构型为分子平衡构型 ...

老师请问vasp里面怎么设置原子相对碰撞速度才能使有能垒的反应合理发生呢？就是调高温度到反应的上限值吗？