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[Amber] antechamber 处理小分子出错

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发表于 7 天前 | 显示全部楼层 |阅读模式
当处理小分子时,最后得到的.frcmod文件中,O-Cl-O键角为0,得到的.prepin的文件中信息不全,不知道哪里出了错,是因为氯比较特殊,所以有什么特殊的处理方法吗?试了好多次都没成功,求解答求解救,之前那个类似的贴子也看了,试了方法没有成功。http://bbs.keinsci.com/thread-6071-1-12.谢谢大家这个是报错信息:
报错.PNG



这个是.perpin的信息:
prepin.PNG
这个是.frcmod的信息
frcmod.PNG

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发表于 7 天前 | 显示全部楼层
这种有机体系里不出现的成键方式没法自动指认恰当的参数,不要以为antechamber什么体系都能搞。
自己去拟合参数补进去

PS:不要在群里和论坛里24小时内问相同问题,群规和置顶的新人必读贴里都写明了
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 楼主| 发表于 5 天前 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2019-7-10 20:47
这种有机体系里不出现的成键方式没法自动指认恰当的参数,不要以为antechamber什么体系都能搞。
自己去拟 ...

好的 谢谢老师  那什么软件或者途径可以拟合参数吗?谢谢老师

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发表于 4 天前 | 显示全部楼层
Lemon- 发表于 2019-7-12 10:28
好的 谢谢老师  那什么软件或者途径可以拟合参数吗?谢谢老师

O-Cl-O用诸如Gaussian扫描个键角,然后用Origin一拟合就完了
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