GPU加速出错问题

dxf

student0618 发表于 2024-6-23 11:04
可參考教程 http://www.mdtutorials.com/gmx/complex/09_analysis.html

链接中的例子
命令：gmx grompp -f ie.mdp -c npt.gro -t npt.cpt -p topol.top -n index.ndx -o ie.tpr

请问这个ie.mdp是最后跑md.mdp还是npt.mdp 呀

student0618

dxf 发表于 2024-6-26 23:17
链接中的例子
命令：gmx grompp -f ie.mdp -c npt.gro -t npt.cpt -p topol.top -n index.ndx -o ie.tpr ...

那教程用的是加了energygrps 的md.mdp

dxf

student0618 发表于 2024-6-27 12:17
那教程用的是加了energygrps 的md.mdp

我仔细看了一下，确实是md.mdp
感谢你的回复