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楼主 Author: sobereva
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[Gaussian/gview] 给def2以ma-方式加弥散函数的Gaussian格式的基组定义文件(含所有def2支持的元素)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-22 21:37:33 | 只看该作者 Only view this author
月夕江YXJ 发表于 2024-2-22 21:19
老师,我在使用这种方法的时候遇到一个问题,因为我需要自定溶剂,输入文件(Linux版)例如:
#M062X/gen  ...

看清楚ma-TZVP.txt末尾有没有额外的空行,有的话会导致自定义溶剂信息没法被读入
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发表于 Post on 2024-2-22 21:41:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-2-22 21:37
看清楚ma-TZVP.txt末尾有没有额外的空行,有的话会导致自定义溶剂信息没法被读入

老师,ma-TZVP.txt是以“****”结尾,我是不是应该使“****”置于末行

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-2-22 21:49:49 | 只看该作者 Only view this author
月夕江YXJ 发表于 2024-2-22 21:41
老师,ma-TZVP.txt是以“****”结尾,我是不是应该使“****”置于末行

我说的是空行,不是****
死活搞不明白就直接把文件里的内容复制到gjf里
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2024-2-22 22:00:56 | 只看该作者 Only view this author
好的,谢谢老师,通过试错明白了
****
[空行]
这种是正确的

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发表于 Post on 2024-11-13 08:33:19 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我最近遇到一个问题是我在引用文件设定基组时出现了无法打开文件的报错 :
Entering Gaussian System, Link 0=g16
Error opening AtFile: /home/Gaussian/ma-TZVP.txt
Error termination via Lnk1e at Tue Nov 12 23:38:54 2024.
之前用同样方法设定同样的基组路径都没问题

输入文件如下:
%nprocshared=32
%mem=12GB
%oldchk=
%chk=
# M062X/gen em=gd3 int=fine geom=allcheck scrf(read,SMD)
【空行】
@/home/Gaussian/ma-TZVP.txt/N
【空行】
eps=11.4
【空行】

想请问老师出现这问题是什么原因

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发表于 Post on 2024-11-13 15:40:25 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,想问一下关于您提到的“里面还有个文件def2-ECP.txt,这是所有def2基组共用的赝势文件,因为def2系列对第五周期开始的元素是赝势基组。”。您之前的帖子《谈谈赝势基组的选用》中提到,“def2系列一大优点是除了锕系以及最后一个周期外覆盖了周期表所有元素,因此对绝大多数体系可以只用def2而无需用混合基组。”。那既然def2是对除了锕系以及最后一个周期外的元素自带赝势,为什么这里还需要引用def2-ECP.txt文件呢?是不是所有第五周期及以后的元素在使用def2时都需要引用该文件呢?谢谢老师。

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发表于 Post on 2024-11-13 16:17:08 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 cokie 于 2024-11-13 16:21 编辑
gqinhao@163.com 发表于 2024-11-13 15:40
老师您好,想问一下关于您提到的“里面还有个文件def2-ECP.txt,这是所有def2基组共用的赝势文件,因为def2 ...

这和你通过genecp用赝势基组是一个意思,先写基组定义,再写赝势定义。
你可以去BSE随便找一个五周期及其之后的Def2系列基组下载看看内容,里面都包含两部分,前面是基组定义、后面是赝势定义。高斯里不需要你给def2系列基组写赝势定义是因为你写了这个关键词就包含了两部分内容罢了。

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发表于 Post on 2024-11-13 16:22:52 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-11-13 16:17
这和你通过genecp用赝势基组是一个意思,先写基组定义,再写赝势定义。

老师您好,但是def2不是直接在关键词行写上基组名字就可以自动调用基组和赝势,不需要分开定义。那为什么def2还要引用def2-ECP.txt文件呢。谢谢老师

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发表于 Post on 2024-11-13 16:31:36 | 只看该作者 Only view this author
gqinhao@163.com 发表于 2024-11-13 16:22
老师您好,但是def2不是直接在关键词行写上基组名字就可以自动调用基组和赝势,不需要分开定义。那为什么 ...

不需要分开定义是因为def2-tzvp这样的关键词,是高斯自己能识别的,你写了这个关键词,高斯自然就会把这个关键词“翻译”成基组定义+赝势定义的组合来用。
你点开看看sob老师写的ma-xxx.txt里的内容,里面是不是没有赝势定义?那自然要再引一个包含赝势定义的def2-ECP.txt文件。
如果你想一个文件搞定,比如对含C,H,O,N,Pt使用的体系使用,你直接把基组定义里C,H,O,N,Pt的部分和赝势定义里Pt的部分按顺序考下来,然后存在一个名为Pt.txt(其实叫啥都行)的文件里,你用的时候只需要引这个就好了。

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发表于 Post on 2024-11-13 16:44:21 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-11-13 16:31
不需要分开定义是因为def2-tzvp这样的关键词,是高斯自己能识别的,你写了这个关键词,高斯自然就会把这 ...

哦哦,那是不是可以理解为引用这个赝势是给弥散计算用的

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发表于 Post on 2024-11-13 16:49:22 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 cokie 于 2024-11-13 16:52 编辑
gqinhao@163.com 发表于 2024-11-13 16:44
哦哦,那是不是可以理解为引用这个赝势是给弥散计算用的

弥散函数在ma-xxxx.txt里,赝势没变,只不过sob老师给他拆出来了。
建议先看看sob老师这篇博文(谈谈赝势基组的选用 - 思想家公社的门口:量子化学·分子模拟·二次元),理解一下什么是赝势,赝势是怎么用的。

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发表于 Post on 2024-11-13 17:00:21 | 只看该作者 Only view this author
cokie 发表于 2024-11-13 16:49
弥散函数在ma-xxxx.txt里,赝势没变,只不过sob老师给他拆出来了。
建议先看看sob老师这篇博文(谈谈赝 ...

好的,谢谢您!

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