团簇模型过渡态搜索的相关问题求助

土拔鼠

各位老师 我在团簇模型下进行过度态的搜索 在PM6D3下找到了过渡态并进行了IRC的验证

将找到的TS的结构重新用B3LYP-D3(BJ)/6-31G* 进行过度态的搜索 但用较高级别的搜索的TS的结构和预想的不一样 虚频方向和并不在催化位点处

我的体系比较大 一共120个原子 B3LYP-D3(BJ)/6-31G* 这个级别算起来已经比较吃力 并且不是每次寻找过渡态都会成功 我想对out进行监测

我有两点想请教一下老师

1. 我在过渡态搜索能量相对稳定的时候 提取构象进行振动分析 得到几个虚频 我是否可以根据虚频有没有包含我想要的反应方向来决定是否有必要继续优化下去？比如我在过渡态搜索20步的时候进行振动分析 发现虚频里不包括我想要的方向 我就可以终止搜索重新摆初猜进行过渡态搜索？我的化学直觉比较差 有时候觉得结构很像 费了半天的劲优化一算振动频率发现虚频方向根本不是反应方向 而且差了十万八千里 并且算一次可能就需要小半天

2. 我是否可以用XTB与Gaussian寻找的过渡态的结果进行热力学校正量的计算并用高精度级别算单点得到自由能 我的体系只有C H O N ，我看老师的博文里说的XTB要比半经验强很多但还是不如DFT 那如果在XTB找的过渡态 验证后是否需要再用DFT再找一遍？用XTB找的过渡态结构进能不能直接用于整个反应的分析讨论

谢谢老师

sobereva

1 可以

2 最好再用常规DFT验证，更何况GFN-xTB比较新，找过渡态的可靠性缺乏相关文章广泛验证。到时候审稿人质疑起来，你还得重算

土拔鼠

sobereva 发表于 2019-9-3 00:05
1 可以

2 最好再用常规DFT验证，更何况GFN-xTB比较新，找过渡态的可靠性缺乏相关文章广泛验证。到时候审 ...

谢谢卢老师的解答