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[NBO相关] NBO5计算电子自旋布局为负值

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大家好,最近在用NBO5计算一个complex 弱相互作用的体系时,计算的自然电子密度产生负值(最后一列),请问是什么原因造成的呢?用Multiwfn+VMD作图后,取0.01等值面,如图2。

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发表于 Post on 2019-9-13 11:19:20 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
自旋密度为-1表示有个beta单电子嘛

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发表于 Post on 2019-9-13 12:50:46 | 只看该作者 Only view this author
自旋布居有负值太正常了,什么含义一看定义便知。仔细看此文
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘制和计算
http://sobereva.com/353http://bbs.keinsci.com/thread-4422-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-9-13 13:45:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-9-13 12:50
自旋布居有负值太正常了,什么含义一看定义便知。仔细看此文
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘 ...

谢谢sob老师

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发表于 Post on 2025-2-3 02:44:27 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-9-13 12:50
自旋布居有负值太正常了,什么含义一看定义便知。仔细看此文
谈谈自旋密度、自旋布居以及在Multiwfn中的绘 ...

sob老师,我想请问下一种情况:金属离子和有机物的配位键发生均裂,形成有机自由基和低价态金属离子,自旋多重度均为5。那此时这个有机自由基的自旋多重度应该是-1还是1呢。

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发表于 Post on 2025-2-3 04:34:00 | 只看该作者 Only view this author
ljh123 发表于 2025-2-3 02:44
sob老师,我想请问下一种情况:金属离子和有机物的配位键发生均裂,形成有机自由基和低价态金属离子,自 ...

“均为5”不知道你指什么
自旋多重度只能为>=1的整数
拿不准基态自旋多重度是什么就对比不同自旋态的能量
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发表于 Post on 2025-2-3 22:45:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-2-3 04:34
“均为5”不知道你指什么
自旋多重度只能为>=1的整数
拿不准基态自旋多重度是什么就对比不同自旋态的能 ...

sob老师我表达的有问题十分不好意思,我的意思就是配位键均裂前和均裂后体系的总自旋多重都都是5。反应物状态时,金属离子和有机物形成配位键,金属离子有4个未成对电子,有机物没有未成对电子。此时配位键发生均裂后,若有机物带有一个未成对电子,也就是失一个电子形成自由基时,该有机自由基总的自旋布居应该是1还是-1呢?

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发表于 Post on 2025-2-4 14:48:39 | 只看该作者 Only view this author
ljh123 发表于 2025-2-3 22:45
sob老师我表达的有问题十分不好意思,我的意思就是配位键均裂前和均裂后体系的总自旋多重都都是5。反应物 ...

1还是-1都一样,本来片段就是单独计算的,1和-1能量都是相同的
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发表于 Post on 2025-2-6 14:57:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-2-4 14:48
1还是-1都一样,本来片段就是单独计算的,1和-1能量都是相同的

感谢sob老师解答。但是如果我想把产物放在一起算的话,我设置自旋多重度应该是5(对应有机自由基自旋布居为-1,金属离子自旋布居为5)还是7呢(对应有机自由基自旋布居为+1,金属离子自旋布居为5)。

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发表于 Post on 2025-2-6 17:45:11 | 只看该作者 Only view this author
ljh123 发表于 2025-2-6 14:57
感谢sob老师解答。但是如果我想把产物放在一起算的话,我设置自旋多重度应该是5(对应有机自由基自旋布居 ...

都已经均裂了,意味着没有相互作用了,毫无理由再一起算
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sobereva 发表于 2025-2-6 17:45
都已经均裂了,意味着没有相互作用了,毫无理由再一起算

sob老师,因为这个过程我是在显式水模型下用AIMD得到的,由于该反应涉及水溶剂的质子转移过程,因此常规DFT考虑隐式溶剂模型的情况下我找不到过渡态以及产物。因此我得到的产物也是一起存在于显式水分子中的。所以可能不太适合分开算。
我对该过程的各个帧计算了自旋布局,发现键均裂后,有些帧的有机物自旋布居接近1,有些帧则接近-1。该过程的总自旋多重度一直为5。这就导致我不太清楚我在计算产物时,因该用自旋布居接近1的帧还是-1的帧

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发表于 Post on 2025-2-7 04:44:06 | 只看该作者 Only view this author
ljh123 发表于 2025-2-6 20:01
sob老师,因为这个过程我是在显式水模型下用AIMD得到的,由于该反应涉及水溶剂的质子转移过程,因此常规D ...

对于片段已经充分分离的轨迹部分,倘若相邻的帧出现了1和-1的突变, 正说明本质上此时1和-1的能量是简并的,没必要区分
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