求助：蛋白质从头构建网站

DoubeeTwT · 发表于 Post on 2019-9-27 13:08:03

我有一段38个氨基酸的短肽没有三维结构，我记得有一个网站是可以输入蛋白质一级序列然后返回给你蛋白质结构的，不过我记不得网址了，是不是有大佬知道的能提供一下，谢谢

puzhongji · 发表于 Post on 2019-9-27 14:37:22

DoubeeTwT · 发表于 Post on 2019-9-29 10:17:53

puzhongji 发表于 2019-9-27 14:37
https://swissmodel.expasy.org/
http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/phyre2/html/page.cgi?id=index
https://z ...

这些都是同源建模的方法吧，我这个肽段好像没有同源模板，似乎需要的是那种完全从头计算的建模

土拔鼠 · 发表于 Post on 2019-9-30 11:59:28

https://www.rosettacommons.org/home

我不太清楚在服务器下载到本地的你可以试试这个 100氨基酸以内的de-nove都可以

eriki · 发表于 Post on 2021-12-15 22:03:41

可以用谷歌colab中的alphafold2程序试一试，网址如下：
https://colab.research.google.co ... in/AlphaFold2.ipynb

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