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楼主 Author: Kellyyyy
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[新手求助] 关于谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算“的例子中的问题

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发表于 Post on 2019-10-5 05:21:44 | 只看该作者 Only view this author
Kellyyyy 发表于 2019-10-4 21:16
还有想请教一下:
用频率因子对热力学参数进行校正的时候,你说到最好的方法是用Gaussian自带的freqchk ...

没法说得更清楚了
做个freq任务显然就有含有Hessian的chk文件
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-5 06:20:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-10-5 05:21
可以。或者用wB97XD

这个可以在A01上使用哈?

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发表于 Post on 2019-10-5 06:54:06 | 只看该作者 Only view this author
Kellyyyy 发表于 2019-10-5 06:20
这个可以在A01上使用哈?

just try
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-5 23:12:27 | 只看该作者 Only view this author

抱歉,还是不大会在零点能校正和构型优化了的基础上,直接更换热力学校正因子。

%oldchk=C:\Users\K\Desktop\20191003\irc1\1narawopt-2.chk
N
303.15
1
1.0102


直接就终止了。
Route card not found.
Error termination

所以,求助

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发表于 Post on 2019-10-6 07:10:39 | 只看该作者 Only view this author
Kellyyyy 发表于 2019-10-5 23:12
抱歉,还是不大会在零点能校正和构型优化了的基础上,直接更换热力学校正因子。

%oldchk=C:%users\K\D ...

完全不知道你想做什么
用freqchk按照提示敲就完了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-24 23:18:10 | 只看该作者 Only view this author
您好!按照您给的算例已经把反应物和产物的能量算完了。在计算过渡态的能量时候出现了一些问题,最终计算终止:
No NMR shielding tensors so no spin-rotation constants.

不知道这是什么原因呢?
输入文件是:
#p opt freq ub3lyp/6-311++g(d,p) scrf=(solvent=water,smd) geom=connect
ivity em=gd3bj scale=0.9887 temperature=303.15

不知道计算过渡态的能量与计算其他稳定化合物的能量有什么区别吗?
还烦请sob大神给与解答,谢谢!

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发表于 Post on 2019-10-26 04:53:03 | 只看该作者 Only view this author
Kellyyyy 发表于 2019-10-24 23:18
您好!按照您给的算例已经把反应物和产物的能量算完了。在计算过渡态的能量时候出现了一些问题,最终计算终 ...

这不是报错
没完整输出文件看不出来
没有区别

没事别给氢加弥散函数,这里说了
谈谈弥散函数和“月份”基组
http://sobereva.com/119

另外,频率校正因子是对气相下拟合的,对于隐式溶剂下的势能面不一定适用。如果你想直接得到算热力学数据,去掉更妥

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-27 11:11:58 | 只看该作者 Only view this author
哦哦,谢谢你!那我再试试。

还想请问一下,模拟出来了物质的紫外吸收谱图之后,能够通过计算得到该物质的摩尔吸光系数吗?

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发表于 Post on 2019-10-28 01:36:32 | 只看该作者 Only view this author
Kellyyyy 发表于 2019-10-27 11:11
哦哦,谢谢你!那我再试试。

还想请问一下,模拟出来了物质的紫外吸收谱图之后,能够通过计算得到该物质 ...

模拟出的紫外谱的纵坐标本身就对应摩尔吸收系数epsilon,此文说了
使用Multiwfn绘制红外、拉曼、UV-Vis、ECD、VCD和ROA光谱图
http://sobereva.com/224
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