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[综合交流] 求助gromacs在服务器上cpu占用率的事

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尊贵的地三鲜骑士

发表于 5 天前 | 显示全部楼层 |阅读模式
图一 是服务器上一个节点的后台图,因为组里多人用该节点而gromacs即使不设置优先级运算的速度也非常快,所以平常即使很多任务在跑(包括8个左右lammps),我的gmx 任务的cpu 能达到800%左右,因为此时还和组里其他人有小的矛盾,放假回来后再跑程序,发现cpu占用率不超过百分之10,而并没有其他任务在跑,想请问各位老师,Linux系统是否可以做到对某个软件进行限速?我的突然减速是偶然吗,我还特意设置了 -nice -20 结果仍然如此。以前的时候设置基本都是 1600%  针对占用率低,我该如何设置呢?谢谢老师帮助!

图一

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由衷的感谢每一位给与过我帮助的人(不爱吃地三鲜的话我们很难做朋友哦)

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发表于 5 天前 | 显示全部楼层
%mem明显异常
杀了续算吧
北京科音自然科学研究中心:http://www.keinsci.com  致力于计算化学的发展和传播,不定期开办各层次量子化学、分子动力学、波函数分析与Multiwfn程序等主题的培训。欢迎加入“北京科音”微信公众号获取培训最新消息和计算化学资讯
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 楼主| 发表于 4 天前 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2019-10-9 22:50
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杀了续算吧

谢谢老师!
由衷的感谢每一位给与过我帮助的人(不爱吃地三鲜的话我们很难做朋友哦)
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