计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
楼主 Author: jackie
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[GROMACS] 求助gmx hbond做氢键分析得到的氢键数量结果

[复制链接 Copy URL]

31

帖子

0

威望

598

eV
积分
629

Level 4 (黑子)

16#
发表于 Post on 2023-8-27 11:37:31 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 ys_song 于 2023-8-27 11:39 编辑
DOUKUN 发表于 2023-8-1 08:23
我的第三列也比第二列小啊,什么原因呢?不知道有没有高人解答

If the program finds a pair shorter than 0.35nm, and the angle is smaller than
30deg., then the program put this pair in the column 2.
If the program finds a pair shorter than 0.35nm, and the angle is larger than
30deg., then the program put this pair in the column 3.
as said here by Jianguo Li.

65

帖子

0

威望

1250

eV
积分
1315

Level 4 (黑子)

17#
发表于 Post on 2025-1-9 19:37:13 | 只看该作者 Only view this author
有什么方法,能输出每一帧中所形成氢键的详细信息吗,比如输出残基名序号,原子名,供受体等?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-15 07:25 , Processed in 0.166058 second(s), 19 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list