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楼主 Author: 树深时见鹿
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[ORCA] ORCA4.2.0在windows下并行报错

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发表于 Post on 2019-11-27 21:49:47 | 只看该作者 Only view this author
你试一下%pal procs 4/8
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发表于 Post on 2019-11-27 22:23:56 | 只看该作者 Only view this author
2~8核直接用pal2~pal8即可,用不着写%pal nprocs
运行不成功明显就是没写ORCA绝对路径,我在我的博文里已经说得详细得不能再详细了

能跑多大的体系不在于windows还是linux,对于ORCA两个平台运行效率都差不多,关键在于用什么机子
4核优化100个原子基本没戏,哪怕用B97-3c这样廉价且保底级别。而算100个原子单点倒是没问题
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-28 15:52:52 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-27 22:23
2~8核直接用pal2~pal8即可,用不着写%pal nprocs
运行不成功明显就是没写ORCA绝对路径,我在我的博文里已 ...

谢谢Sob老师,确实是核数出错还有绝对路径的问题,后来修改过来了,但是运行的时候发现ORCA里4核并行还是不能完全调用8个线程。
还想问下Sob老师,在MS下优化好的结构可以直接用ORCA或Gaussian算单点得到波函数吗?可以不可以省略高斯或ORCA的优化步骤呢?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-28 15:54:50 | 只看该作者 Only view this author
duguex 发表于 2019-11-27 21:49
你试一下%pal procs 4/8
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好的,谢谢啦。不过Sob老师后来回复了,2-8核可以直接写pal2~pal8。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-28 15:57:38 | 只看该作者 Only view this author
lao7 发表于 2019-11-27 21:43
看你在什么计算水平下跑?一般常规水平吧 100个原子 B3LYP/6-31G 跑不起来!

linux下跑 B3LYP/6-31G O ...

win下的资源有限,不过linux下最多可以调用16个核,%nprocs=16,速度应该会快点。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-28 16:01:06 | 只看该作者 Only view this author
lao7 发表于 2019-11-27 21:45
我不到100个原子,这个计算水平下。24个核心,48个线程的V3处理器,128G内存。都要几乎十几个小时!

昨天在linux下提交了一个100多个原子的任务,16个核心,30G内存,用的Gauusian09,但是用B3LYP/6-31G报错说基组太小,体系原子数目太多,后来换成了B3LYP/def2-TZVP不知道要跑多久?

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发表于 Post on 2019-11-28 17:08:19 | 只看该作者 Only view this author
树深时见鹿 发表于 2019-11-28 16:01
昨天在linux下提交了一个100多个原子的任务,16个核心,30G内存,用的Gauusian09,但是用B3LYP/6-31G报错 ...

要分配60G以上内存,TZVP就更算不动了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-28 18:48:58 | 只看该作者 Only view this author
lao7 发表于 2019-11-28 17:08
要分配60G以上内存,TZVP就更算不动了。

TZVP算不动100个原子的吗?还是内存要60G才可以算呀?

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发表于 Post on 2019-11-28 19:28:54 | 只看该作者 Only view this author
Linux平台Gaussian没有算不动的,只怕你等不起!

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发表于 Post on 2019-11-29 08:37:28 | 只看该作者 Only view this author
树深时见鹿 发表于 2019-11-28 15:52
谢谢Sob老师,确实是核数出错还有绝对路径的问题,后来修改过来了,但是运行的时候发现ORCA里4核并行还是 ...

要求ORCA四核并行凭什么会调用8个线程?

另外,仔细看此文了解超线程
正确认识超线程(HT)技术对计算化学运算的影响
http://sobereva.com/392

如果M$里优化的级别恰当,可以这样
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发表于 Post on 2019-11-29 08:38:35 | 只看该作者 Only view this author
树深时见鹿 发表于 2019-11-28 16:01
昨天在linux下提交了一个100多个原子的任务,16个核心,30G内存,用的Gauusian09,但是用B3LYP/6-31G报错 ...

没有因为基组太小而报错一说

用6-31G不带极化纯属搞笑,仔细看
谈谈量子化学中基组的选择
http://sobereva.com/336http://bbs.keinsci.com/thread-3545-1-1.html

优化用def2-TZVP纯粹瞎糟蹋时间,撑死了def-TZVP也够了,仔细看上文
注意分清楚def和def2

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发表于 Post on 2019-11-29 08:39:19 | 只看该作者 Only view this author
树深时见鹿 发表于 2019-11-28 18:48
TZVP算不动100个原子的吗?还是内存要60G才可以算呀?

普通DFT泛函优化跟本就不耗多少内存,10GB都能跑
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-29 08:58:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-29 08:37
要求ORCA四核并行凭什么会调用8个线程?

另外,仔细看此文了解超线程

谢谢Sob老师!MS里优化的级别是GGA-PBE,应该可以直接用高斯算单点。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-29 08:59:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-29 08:39
普通DFT泛函优化跟本就不耗多少内存,10GB都能跑

好的。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-29 10:24:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-29 08:38
没有因为基组太小而报错一说

用6-31G不带极化纯属搞笑,仔细看

Sob老师,我如果要对体系的波函数和偶极矩都进行分析,那针对体系的波函数,用B3LYP/6-311G+(d)的话,在高斯的.gjf文件也是这样写吗?之前选择的方法是def2-TZVP,在高斯里却写成def2tzvp。

针对体系的偶极矩,用B3LYP/def2-TZVP,应该可以了吧?

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