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[Multiwfn使用咨询] “空穴”与“电子”的组成

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楼主
Multiwfn 3.3.7的空穴-电子功能可以产生电子密度差分图、空穴及电子的cube文件,也可以计算空穴与电子中各原子的贡献。
如果要用Hirshfeld方法计算空穴及电子的组成,请问应如何设置?默认计算的似乎是Becke组成。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-8-14 11:21:09 | 只看该作者 Only view this author
以下是此前版主说的做电子-空穴分析后定量比较某类原子在激发态中的组成的方法:

“最简单的就是直接用记录了NTO轨道的fch文件照常做轨道成分分析。
也可以对“电子”或者“空穴”分布进行定量分析考察每个原子的贡献,只不过步骤多一些。具体来说,就是先导出电子或空穴的.cub文件,然后再将settings.ini里的iuserfunc设为-1(此时用户自定义函数就对应于根据cube文件插值出的函数),然后把cub文件载入Multiwfn,进入主功能15模糊空间分析,选1对指定函数在各个原子空间中进行积分,然后选100用户自定义函数,就可以看到每个原子对这个cube文件所记录的函数的贡献了。如果cube文件格点不够精细,可能原子贡献之和偏离100%多一些,可以自行归一化。”

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发表于 Post on 2015-8-15 02:22:14 | 只看该作者 Only view this author
进入主功能15后,选-1,然后选Hirshfeld即可。之后对模糊原子空间进行积分的时候会让你选择原子密度的来源,一般就选1用自带的球对称化的原子自由状态下的密度即可
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-8-16 20:58:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-8-15 02:22
进入主功能15后,选-1,然后选Hirshfeld即可。之后对模糊原子空间进行积分的时候会让你选择原子密度的来源 ...

进入主功能15后,选-1,见以下文字:
Select atomic space partition method
1 Becke
2 Hirshfeld
3 Hirshfeld*

选择3,回车,然后选择1,
1 Perform integration in fuzzy atomic spaces for a real space function
回车,见以下文字,
8 Electrostatic potential from nuclear charges
14 Reduced density gradient(RDG) with promolecular approximation
16 Sign(lambda2)*rho with promolecular approximation
100 User defined real space function, iuserfunc= -1
-2 Deformation density

选择100,回车,好像一直没见到“之后对模糊原子空间进行积分的时候会让你选择原子密度的来源”的选项......

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发表于 Post on 2015-8-16 21:17:03 | 只看该作者 Only view this author
虎王 发表于 2015-8-16 20:58
进入主功能15后,选-1,见以下文字:
Select atomic space partition method
1 Becke


记错了,你选择Hirshfeld*本身就代表用内置的原子球对称化的密度了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-1-16 23:48:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-8-15 02:22
进入主功能15后,选-1,然后选Hirshfeld即可。之后对模糊原子空间进行积分的时候会让你选择原子密度的来源 ...

假如分析组成之后忘了把settings.ini里的iuserfunc还原为0,会影响Multiwfn的哪些功能呢?突然想到这个问题。尽管我都会很小心的改回去。

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发表于 Post on 2016-1-16 23:55:57 | 只看该作者 Only view this author
虎王 发表于 2016-1-16 23:48
假如分析组成之后忘了把settings.ini里的iuserfunc还原为0,会影响Multiwfn的哪些功能呢?突然想到这个问 ...

不会有什么影响。
仅当你考察的东西涉及到user defined function才会受这个影响
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