已知有哪些单糖构成了，请问有没有专门的建模工具呢？

mol · 发表于 Post on 2020-3-3 09:27:50

各位老师好，最近想模拟一下多糖，已知有哪些单糖构成了，请问有没有专门的建模工具呢？

wangzhe · 发表于 Post on 2020-3-3 09:56:05

个人想法：可以用spartan建一个单糖的模型库，然后组建多糖。

sobereva · 发表于 Post on 2020-3-3 10:37:05

对于自己手画的情况，在gview里画出来各种单体，都添加为自定义片段，之后每点击一次就能增加一个单元

这上面也有相关工具http://glycam.org/

mol · 发表于 Post on 2020-3-3 13:57:47

sobereva 发表于 2020-3-3 10:37
对于自己手画的情况，在gview里画出来各种单体，都添加为自定义片段，之后每点击一次就能增加一个单元

...

感谢sob老师，也谢谢帮助修改标题

robert2005 · 发表于 Post on 2020-3-4 22:43:59

Discovery Studio Visualizer里面可以直接根据糖链序列直接画出三维结构，因为里面包含了很多的各种类型单糖分子的完整单体结构，选择相应的氢原子点击，就可以连接成为我们想要的1,4或1,6糖苷键，非常方便的。

robert2005 · 发表于 Post on 2020-3-4 22:46:02

操作界面

robert2005 · 发表于 Post on 2020-3-4 22:47:16

mol · 发表于 Post on 2020-3-5 09:36:01

robert2005 发表于 2020-3-4 22:43
Discovery Studio Visualizer里面可以直接根据糖链序列直接画出三维结构，因为里面包含了很多的各种类型单 ...

太详细了，感谢前辈！

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