如何解释分子动力学模拟时间过短，与实际相差太大？

tanghuanhgd · 发表于 Post on 2020-3-3 20:06:40

实际实验达到平衡要几个小时，而MD只能计算ns级，如何能说明MD中观察到的现象可以揭示实际实验的机理？

wuzhiyi · 发表于 Post on 2020-3-4 07:10:53

你超算没选对
换anton2就可以跑毫秒级别的模拟了

fhh2626 · 发表于 Post on 2020-3-4 09:38:32

用增强采样算法

bobosiji · 发表于 Post on 2020-3-4 09:50:39

具体问题具体分析。考虑代表性取样

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[综合交流] 如何解释分子动力学模拟时间过短，与实际相差太大？