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[Multiwfn使用咨询] 求助:基于multiwfn产生的cube文件以及vmd软件如何画多层次的电子轨道示意图?

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发表于 2020-3-4 16:05:49 | 显示全部楼层 |阅读模式
基于multiwfn产生的cube文件以及vmd软件如何画多层次的电子轨道或电子密度示意图?具体形式如附件图片。原理上是画四层isosurface, 从内向外,每层的透明度不同,比如80%, 60%, 40%,20% 。请问具体如何在vmd中实现?




多层轨道结构示意图

多层轨道结构示意图
图片1.png

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发表于 2020-3-5 02:05:06 | 显示全部楼层
graphics - representation里设多个rep,都用透明等值面方式显示,每个rep的isovalue设为不同。不需要单独设不同透明度,叠加次数越多自然颜色就会越深。
整体透明度可以在graphics - materials里改相应材质的opacity

Clipboard01.jpg

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发表于 2021-3-13 10:18:26 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2020-3-5 02:05
graphics - representation里设多个rep,都用透明等值面方式显示,每个rep的isovalue设为不同。不需要单独 ...

社长大人,想提个不情之请,可否把您画这张图的tcl(发给俺学习一下,多次尝试没有成功可能是哪个参数搞错了

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发表于 2021-3-14 02:59:31 | 显示全部楼层
yiwei 发表于 2021-3-13 10:18
社长大人,想提个不情之请,可否把您画这张图的tcl(发给俺学习一下,多次尝试没有成功可能是哪个参数搞 ...

没有tcl。基本过程这里说了

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发表于 2021-3-14 12:19:24 | 显示全部楼层
sobereva 发表于 2021-3-14 02:59
没有tcl。基本过程这里说了

谢谢社长大人,已找到原因…(渲染下就好

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发表于 2021-3-15 05:24:26 | 显示全部楼层
yiwei 发表于 2021-3-14 12:19
谢谢社长大人,已找到原因…(渲染下就好

只要你开了GLSL,不需要渲染就能直接看到这个效果
不开GLSL的话是看不到真实的透明的效果的
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