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[GROMACS] 求助gromacs里哪条指令可以在关掉gpu加速的情况下rerun重新生成能量文件

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  各位老师,各位大佬,感谢点击我的求助帖。
  我最近在计算分子相互作用能,但是前辈说开着gpu加速跑出来的能量数据是有误的,让我关了gpu加速去rerun。所以我想问一下怎么才能在rereun时关掉gpu加速,谢谢大家。

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发表于 Post on 2020-3-5 14:28:45 | 只看该作者 Only view this author
我的理解可能需要编译一个cpu版

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发表于 Post on 2020-3-5 14:31:36 | 只看该作者 Only view this author
尝试mdrun时候-nb cpu
用CPU版也可以
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-5 15:51:15 | 只看该作者 Only view this author
mol 发表于 2020-3-5 14:28
我的理解可能需要编译一个cpu版

我考虑一下,谢谢啊

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-3-5 15:52:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-3-5 14:31
尝试mdrun时候-nb cpu
用CPU版也可以

谢谢sob老师,我去搞一下。

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发表于 Post on 2020-3-5 19:48:49 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wuzhiyi 于 2020-3-6 17:16 编辑

GPU加速能量错误是怎么回事啊?愿闻其详,我一直都GPU加速跑rerun的而且我记得如果Gromacs如果在编译的时候 没加GPU支持的话 会导致rerun能量是错的
详情见https://redmine.gromacs.org/issues/3400

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