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楼主 Author: Eming
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[VMD] 小脚本-vmd画虚线

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-12-4 11:33:12 | 只看该作者 Only view this author
Qingming 发表于 2023-12-1 21:55
究竟怎么用啊,有没有详细点的教程,输入参数好不明确,不知道该怎么输

#Usage example:
#draw_bond -mol1 0 -index1 1 -mol2 1 -index2 1 -h_nbars 25 -h_space 1 -h_arrow 0 -h_radius 0.1 -color yellow -mat Opaque -h_type cylinder -h_resol 25
#--->以下是选项介绍:
# -mol1 0; 第一个原子所在分子的ID
# -index1 200; 第一个原子的index号
# -mol2 0; 第二个原子所在分子的ID
# -index2; 第二个原子的index号
# -h_nbars 25; 虚线的段数
# -h_space 1; 虚线的空隙大小
# -h_arrow 0; 虚线两端要不要画个箭头啊
# -h_radius 0.1; 虚线的粗细
# -color yellow; 虚线的颜色
# -mat Opaque; 虚线的材质
# -h_type cylinder; 虚线的风格,支持sphere, cylinder, pymol, cone, line几种风格,
# -h_reol 25; 虚线的分辨率,平滑度

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发表于 Post on 2023-12-4 14:11:38 | 只看该作者 Only view this author
Eming 发表于 2023-12-4 11:33
#Usage example:
#draw_bond -mol1 0 -index1 1 -mol2 1 -index2 1 -h_nbars 25 -h_space 1 -h_arrow 0  ...

哇,谢谢楼主,差不多十年的帖子了,感谢

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发表于 Post on 2024-4-7 21:35:47 | 只看该作者 Only view this author
请问这是什么原因呢

202404072135339618..png (8.96 KB, 下载次数 Times of downloads: 20)

202404072135339618..png

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19#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-4-9 14:01:51 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Eming 于 2024-4-9 14:04 编辑
fitterluo 发表于 2024-4-7 21:35
请问这是什么原因呢

没有加载脚本吧,source draw_bond.tcl

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20#
发表于 Post on 2024-5-13 11:58:50 | 只看该作者 Only view this author
楼主您好!可以将虚线的起点设置为某分子片段的中心吗?比如二茂铁中Cp环的中心,谢谢!

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