计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 11076|回复 Reply: 18
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Linux] 请教关于Linux上的Gaussian安装的问题

[复制链接 Copy URL]

206

帖子

1

威望

4096

eV
积分
4322

Level 6 (一方通行)

各位老师好,本人从学校借的Gaussian16的光盘里面有5个安装包(不知道这种说法对不对,我把图贴在下面)。电脑CPU是i7-9700KF,主系统Windows10安装了虚拟机Debian 10。我对电脑不是很懂,试了几个好像能用,请问有没有什么计算速度之类的影响?用哪个最合适?

谢谢各位老师的回答。
注:图片括号里前面四个写的是Linux Binary,最后一个是Source Code: Need to Compile

キャプチャ.JPG (94.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 70)

キャプチャ.JPG
Ph.D. (Hiroshima Univ.), PostDoc @Kyoto University
E-mail: wang.zhe.dr@gmail.com
Homepage: wongzit.github.io

1242

帖子

1

威望

3670

eV
积分
4932

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2020-5-26 10:55:48 | 只看该作者 Only view this author
用AVX2的

1187

帖子

5

威望

2859

eV
积分
4146

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2020-5-26 11:39:23 | 只看该作者 Only view this author

随便从某网站上摘的说明
但是他这个最上面那行Linux命令不对,-o的话avx2关键词虽然含有avx关键词,但是那个2不会被显示出来。
建议先用下面命令来查看CPU是否支持AVX2指令集,然后再执行上面那条脚本,看其他的指令集。
  1. grep -o -e avx2 /proc/cpuinfo
复制代码


评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
hebrewsnabla + 3

查看全部评分 View all ratings

206

帖子

1

威望

4096

eV
积分
4322

Level 6 (一方通行)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-26 12:01:23 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2020-5-26 12:39
随便从某网站上摘的说明
但是他这个最上面那行Linux命令不对,-o的话avx2关键词虽然含有avx关键词,但 ...

非常感谢,我这就去试试。
Ph.D. (Hiroshima Univ.), PostDoc @Kyoto University
E-mail: wang.zhe.dr@gmail.com
Homepage: wongzit.github.io

206

帖子

1

威望

4096

eV
积分
4322

Level 6 (一方通行)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-26 12:02:04 | 只看该作者 Only view this author

非常感谢
Ph.D. (Hiroshima Univ.), PostDoc @Kyoto University
E-mail: wang.zhe.dr@gmail.com
Homepage: wongzit.github.io

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120109

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2020-5-26 15:41:05 | 只看该作者 Only view this author
i7-9700KF支持AVX2
不知道支持什么指令集,在我整理的硬件资料库里一查就知道:http://sobereva.com/datasheet.rar
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

206

帖子

1

威望

4096

eV
积分
4322

Level 6 (一方通行)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-5-26 16:43:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-5-26 16:41
i7-9700KF支持AVX2
不知道支持什么指令集,在我整理的硬件资料库里一查就知道:http://sobereva.com/datas ...

谢谢老师,资料库已收藏。
Ph.D. (Hiroshima Univ.), PostDoc @Kyoto University
E-mail: wang.zhe.dr@gmail.com
Homepage: wongzit.github.io

66

帖子

0

威望

704

eV
积分
770

Level 4 (黑子)

8#
发表于 Post on 2020-6-23 17:58:52 | 只看该作者 Only view this author
和09版本差别大吗

2407

帖子

1

威望

5950

eV
积分
8377

Level 6 (一方通行)

9#
发表于 Post on 2020-6-23 23:39:57 | 只看该作者 Only view this author
huozhong 发表于 2020-6-23 17:58
和09版本差别大吗

g09。一般采用12核心最高16核心并行,效率还凑合,再多核心,就开始慢了。

g16, 请使用主板上所有的CPU核心,比如28, 56核心;

如果是4颗处理器,具体测试一下吧。 没有这种机器,不晓得。

我能用到的激发态计算/TD-DFT部分,比g09,快,大概是3天到1.5天的差异。 其他不明。

具体可以查询release note。
High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

66

帖子

0

威望

704

eV
积分
770

Level 4 (黑子)

10#
发表于 Post on 2020-6-24 22:41:05 | 只看该作者 Only view this author
abin 发表于 2020-6-23 23:39
g09。一般采用12核心最高16核心并行,效率还凑合,再多核心,就开始慢了。

g16, 请使用主板上所有的 ...

非常感谢

739

帖子

0

威望

1715

eV
积分
2454

Level 5 (御坂)

11#
发表于 Post on 2020-6-25 10:27:22 | 只看该作者 Only view this author
第一个即可。应该分享出来,试用一下再给建议

206

帖子

1

威望

4096

eV
积分
4322

Level 6 (一方通行)

12#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-6-25 14:31:40 | 只看该作者 Only view this author
lao7 发表于 2020-6-25 11:27
第一个即可。应该分享出来,试用一下再给建议

从学校拿的不敢随便发出来
Ph.D. (Hiroshima Univ.), PostDoc @Kyoto University
E-mail: wang.zhe.dr@gmail.com
Homepage: wongzit.github.io

62

帖子

0

威望

1059

eV
积分
1121

Level 4 (黑子)

13#
发表于 Post on 2020-6-25 15:46:12 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Peter_zhong 于 2020-6-25 15:47 编辑
abin 发表于 2020-6-23 23:39
g09。一般采用12核心最高16核心并行,效率还凑合,再多核心,就开始慢了。

g16, 请使用主板上所有的 ...

请问哪里有测试的帖子或者文章吗? 可否提供一下连接,谢谢。我按照老师的建议如下图(Gaussian的安装方法及运行时的相关问题http://sobereva.com/439),平时用Linux g09D 计算opt+freq 单个任务 都是给32核。有次给了16核测试了一下,不知道是不是心理原因作怪,感觉好久,没优化几步任务就被我kill了。

高斯核数.png (90.59 KB, 下载次数 Times of downloads: 58)

高斯核数.png

2407

帖子

1

威望

5950

eV
积分
8377

Level 6 (一方通行)

14#
发表于 Post on 2020-6-25 18:35:45 | 只看该作者 Only view this author
Peter_zhong 发表于 2020-6-25 15:46
请问哪里有测试的帖子或者文章吗? 可否提供一下连接,谢谢。我按照老师的建议如下图(Gaussian的安装方 ...

我自己测的。
High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

2407

帖子

1

威望

5950

eV
积分
8377

Level 6 (一方通行)

15#
发表于 Post on 2020-6-25 19:03:10 | 只看该作者 Only view this author
Peter_zhong 发表于 2020-6-25 15:46
请问哪里有测试的帖子或者文章吗? 可否提供一下连接,谢谢。我按照老师的建议如下图(Gaussian的安装方 ...

我说我自己测的,
直接分享经验,会被唾弃和鄙视。

既然喜欢看参考,来来,我随便搜索了一下。
gaussian 09 parallel efficiency
你可以看看。

https://www.chpc.utah.edu/documentation/software/gaussian09.php
https://nusit.nus.edu.sg/service ... s-more-efficiently/
https://computational-chemistry. ... ussian16-benchmark/

少看那些莫名其妙的中文资料。

另,不自己搜索看看吗?

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
Peter_zhong + 3 谢谢

查看全部评分 View all ratings

High-Performance Computing for You
为您专属定制的高性能计算解决方案

更多讯息,请访问:
https://labitc.top
http://tophpc.top:8080
电邮: ask@hpc4you.top

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-14 04:10 , Processed in 0.207401 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list