计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 26317|回复 Reply: 20
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 高斯是否可以计算oxidation and reduction potentials?

[复制链接 Copy URL]

26

帖子

0

威望

122

eV
积分
148

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
我看了SoB老师的博文但是没有找到有关高斯是否可以computed oxidation and reduction potentials 的信息,请问有谁见过可否给发个链接

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112384

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2015-9-23 14:24:44 | 只看该作者 Only view this author
任何主流的量子化学程序,只要支持溶剂模型、能算自由能的,都能算氧化/还原势。
需要计算的是得/失电子过程的气相自由能变(推荐用热力学组合方法算),以及得/失电子前后物种的溶解自由能(推荐用SMD模型),加在一起就是在溶液下得/失电子过程的自由能变,分别根据E_red=-ΔG_red/nF和E_ox=ΔG_ox/nF,就分别得到了绝对还原/氧化势,减去4.44V就是相对于标准氢电极的。

还原势计算综述:
Phys. Chem. Chem. Phys., 2014, 16, 15068-15106
氧化势计算例子:
Phys. Chem. Chem. Phys., 2000, 2, 1231-1239

PS1:帖子标题请反应帖子内容,已进行了更改。

PS2:没有专门博文说这事,但会在北京科音基础量化培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KBQC_content.html)上讲。

评分 Rate

参与人数
Participants 1
eV +3 收起 理由
Reason
tjuptz + 3 谢谢

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

42

帖子

0

威望

2095

eV
积分
2137

Level 5 (御坂)

3#
发表于 Post on 2017-2-8 03:00:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-9-23 14:24
任何主流的量子化学程序,只要支持溶剂模型、能算自由能的,都能算氧化/还原势。
需要计算的是得/失电子过 ...

请问Sob老师,三重态中性分子的还原势该怎么计算呢?用gview的话三重态分子得到一个电子,分子的电荷和多重度会从0 3 变成了-1 2。这样得电子的自由能变是用 -1 2 物种的自由能减去 0 3 物种的自由能吗,还是需要什么其他的处理方法呢?谢谢您!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112384

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2017-2-8 14:01:29 | 只看该作者 Only view this author
RickyE 发表于 2017-2-8 03:00
请问Sob老师,三重态中性分子的还原势该怎么计算呢?用gview的话三重态分子得到一个电子,分子的电荷和多 ...

就是这样
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

720

帖子

0

威望

1252

eV
积分
1972

Level 5 (御坂)

5#
发表于 Post on 2017-2-9 13:29:57 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-9-23 14:24
任何主流的量子化学程序,只要支持溶剂模型、能算自由能的,都能算氧化/还原势。
需要计算的是得/失电子过 ...

Sob老师,如果对于离子液体或者熔岩体系,应该如何来获得氧化还原电位呢?
谢谢老师

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112384

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2017-2-9 21:49:24 | 只看该作者 Only view this author
lastzealot 发表于 2017-2-9 13:29
Sob老师,如果对于离子液体或者熔岩体系,应该如何来获得氧化还原电位呢?
谢谢老师


计算这种体系的氧化还原电位我没见过,常规方法应该不行
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

720

帖子

0

威望

1252

eV
积分
1972

Level 5 (御坂)

7#
发表于 Post on 2017-2-9 23:07:57 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-2-9 21:49
计算这种体系的氧化还原电位我没见过,常规方法应该不行

谢谢老师

586

帖子

0

威望

4191

eV
积分
4777

Level 6 (一方通行)

8#
发表于 Post on 2020-11-25 16:44:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-9-23 14:24
任何主流的量子化学程序,只要支持溶剂模型、能算自由能的,都能算氧化/还原势。
需要计算的是得/失电子过 ...

自由能变的单位由hartee换算成eV带入公式E_red=-ΔG_red/nF ?F的值是96485,算出来的E_red就是V吗?还需要怎么换算单位吗?

1万

帖子

0

威望

7396

eV
积分
18151

Level 6 (一方通行)

9#
发表于 Post on 2020-11-25 19:41:55 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2020-11-25 16:44
自由能变的单位由hartee换算成eV带入公式E_red=-ΔG_red/nF ?F的值是96485,算出来的E_red就是V吗?还需 ...

除以F本身就是换算成eV的过程
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

586

帖子

0

威望

4191

eV
积分
4777

Level 6 (一方通行)

10#
发表于 Post on 2020-11-25 23:18:25 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-11-25 19:41
除以F本身就是换算成eV的过程

那ΔG的单位是什么啊?

1633

帖子

4

威望

4093

eV
积分
5806

Level 6 (一方通行)

喵星人

11#
发表于 Post on 2020-11-25 23:44:51 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2020-11-25 23:18
那ΔG的单位是什么啊?

该是啥还是啥

586

帖子

0

威望

4191

eV
积分
4777

Level 6 (一方通行)

12#
发表于 Post on 2020-11-26 15:49:35 | 只看该作者 Only view this author

高斯输出文件G的能量hartee直接带入公式吗?

1万

帖子

0

威望

7396

eV
积分
18151

Level 6 (一方通行)

13#
发表于 Post on 2020-11-26 20:28:19 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2020-11-26 15:49
高斯输出文件G的能量hartee直接带入公式吗?

什么单位都行,只要和F的单位匹配就行
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112384

管理员

公社社长

14#
发表于 Post on 2020-11-27 11:00:42 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2020-11-26 15:49
高斯输出文件G的能量hartee直接带入公式吗?

自由能换算成eV,除以n就是V
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

586

帖子

0

威望

4191

eV
积分
4777

Level 6 (一方通行)

15#
发表于 Post on 2020-11-27 16:27:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-27 11:00
自由能换算成eV,除以n就是V

好的,知道了,谢谢社长!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-25 11:42 , Processed in 0.368811 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list