Gaussian找H转移过渡态改变键长很多次，都没有找到。有没有其他什么方法？

悠哉2020 · 发表于 Post on 2020-6-11 11:33:00

H转移的过渡态是不是最难找的，改变键长很多次，都没有找到。有没有其他什么方法？

cottondog · 发表于 Post on 2020-6-11 11:37:57

硕士时候找过很多个氢转移，一般不是键长问题，考虑体系电荷，手性，是否有水做催化剂，多个氢转移的先后顺序等问题，其他还有方法基组自旋等基础问题

悠哉2020 · 发表于 Post on 2020-6-11 11:49:27

cottondog 发表于 2020-6-11 11:37
硕士时候找过很多个氢转移，一般不是键长问题，考虑体系电荷，手性，是否有水做催化剂，多个氢转移的先后顺 ...

老师，您好！确实是两个H同时转移的，这个该怎么考虑先后顺序呢？新手还请老师指教

cottondog · 发表于 Post on 2020-6-11 12:23:53

一共就俩，都试试呗，做个柔性扫描看看，可能都没有过渡态

悠哉2020 · 发表于 Post on 2020-6-11 13:27:44

cottondog 发表于 2020-6-11 12:23
一共就俩，都试试呗，做个柔性扫描看看，可能都没有过渡态

老师，那我是同时扫描两个键长吗？还是扫描一个就行？肯定会存在过渡态的吧！

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2020-6-11 13:35:29

悠哉2020 发表于 2020-6-11 13:27
老师，那我是同时扫描两个键长吗？还是扫描一个就行？肯定会存在过渡态的吧！

对两根键同时改变的，一维柔性扫描经常给出误导性的结果。二维扫描好一点，但注意也不能保证成功，即找到了是好事，没扫出来也别就下结论说过渡态不存在。

存不存在过渡态得说清是氢什么转移，最好把结构画出来。并不是“氢转移”就一定有过渡态。

悠哉2020 · 发表于 Post on 2020-6-11 13:52:02

liyuanhe211 发表于 2020-6-11 13:35
对两根键同时改变的，一维柔性扫描经常给出误导性的结果。二维扫描好一点，但注意也不能保证成功，即找到 ...

老师，是一个水分子辅助烯烃H转移的过程。老师，如果用二维扫描键长，一般情况下每个键长扫几个点？

sobereva · 发表于 Post on 2020-6-11 22:14:27

看清楚板块再发贴，学术问题求助帖不要发到“公社大厅”版块里！已经把你的帖子移动了。下次如果发错将直接删帖处理。

如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并反映出帖子具体内容，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“Gaussian H转移过渡态”改了，以后务必注意，下次将扣分处理。

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2020-6-11 22:44:12

悠哉2020 发表于 2020-6-11 13:52
老师，是一个水分子辅助烯烃H转移的过程。老师，如果用二维扫描键长，一般情况下每个键长扫几个点？

没有定数，与你可接受的“误差”、和你不确定的键长范围有关。例如有的过渡态很浅，就需要较多的点（以及较好的扫描“设计”）使之处于里过渡态很近的位置才能优化得到，有的过渡态则即使初猜不好，也能优化的过去。

另外水分子辅助烯烃氢转移看迷糊了，最好还是给个图，这机理描述直观上感觉“不适”。

另外别只关注键长，其他几何变量也应注意是否合理，其他变量不合理，柔性扫描做的再细也没有用。

悠哉2020 · 发表于 Post on 2020-6-12 11:18:47

本帖最后由悠哉2020 于 2020-6-13 19:17 编辑

liyuanhe211 发表于 2020-6-11 22:44
没有定数，与你可接受的“误差”、和你不确定的键长范围有关。例如有的过渡态很浅，就需要较多的点（以及 ...

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