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楼主 Author: snow_wl
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[Multiwfn使用咨询] 关于AdNDP

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-11-13 10:00:30 | 只看该作者 Only view this author
谢谢老师,跟您学了很多

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-11-24 08:58:42 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2014-11-13 00:54
可以算多中心键级,见
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://hi.baidu.com/sobereva ...

sob老师,我想问一下,您说的载入molden后分析多中心键的键级可以用-2那个选项吗(即based on NAO),因为我为了避免直接用基函数分析键级(选项2)会因为基组有弥散函数有错误,但是像您手册中写的用-2选项程序就会闪退没法分析。是不是molden里没有NAO信息的原因?我仍想对我分析得到的多中心键进行键级分析,有没有更可靠的方法呢,我的基函数里是有弥散成分的。

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发表于 Post on 2014-11-24 09:07:42 | 只看该作者 Only view this author
弥散函数对于AdNDP分析没有意义,对于常规方式计算多中心键级更是不能有。最好的办法就是在你做AdNDP分析之前就把弥散函数去掉,几乎不会影响AdNDP分析结果。
-2那种基于NAO计算多中心键级的方法必须依靠NBO程序的输出信息才能用,手册里有说明。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-11-24 09:54:28 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 snow_wl 于 2014-11-24 09:57 编辑
sobereva 发表于 2014-11-24 09:07
弥散函数对于AdNDP分析没有意义,对于常规方式计算多中心键级更是不能有。最好的办法就是在你做AdNDP分析之 ...
我算了一个含有Nd和F的分子,Nd的基组是cVTZ-pp,赝势是ECP10MDF,F的是6-311+g*。有如下问题:
1.我要是想分析多中心键级,可不可以先用上述基组来opt,然后再用没有弥散的来做AdNDP分析,这样的结果可靠吗,还是也要用没有弥散的基组重新opt一下。
2.要是想去掉弥散,是换一个没有弥散的基组,还是在基组信息里手动删除那些含有弥散成分的基函数。
3.若手动删除,基函数指数部分小于多少可以算是弥散呢?4.Nd的基组是cvtz-pp,这种基组有弥散的成分吗,是只有前面加了aug才有弥散吧?

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发表于 Post on 2014-11-24 11:07:59 | 只看该作者 Only view this author
1 没问题
2,3 去掉弥散函数即可,F改用6-311G*
4 无弥散。虽然3-zeta基组最外层的基函数也稍微有一点点弥散特征,但通常问题不大。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-11-24 11:56:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2014-11-24 11:07
1 没问题
2,3 去掉弥散函数即可,F改用6-311G*
4 无弥散。虽然3-zeta基组最外层的基函数也稍微有一点点弥 ...

好的,谢谢您的回答!!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-12-2 15:06:28 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 snow_wl 于 2014-12-2 15:12 编辑

老师我还想针对多中心键级问一个问题。如果三个原子分别记为1,2,3,三者之间存在三中心键1--2--3,而且1--2,2--3之间都存在2c-2e,如何计算1--2或者2--3之间的键级?
我可不可以用multiwfn多中心键级模块中先分别计算1--2和2--3的两中心键级(将三中心键的占据数设为0),再将两个1--2,2--3二中心轨道占据设为零,基于剩下的1--2--3三中心二电子轨道分别计算1--2和2--3的键级,最后做加和。这样可以吗?补充一下,如果1--2--3的三中心键级设为a,基于这个三中心键的情况下1--2和2--3的键级均为b(我的体系中2和3是相同的)a和b有什么换算关系吗,为什么我的a和b相差很大呢?

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发表于 Post on 2014-12-2 15:53:55 | 只看该作者 Only view this author
多中心键级和双中心键级是独立的。
计算三中心键级用主功能9里面的选项2,计算双中心键级用其中选项1。我没明白为什么你搞得那么复杂。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-12-2 16:15:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2014-12-2 15:53
多中心键级和双中心键级是独立的。
计算三中心键级用主功能9里面的选项2,计算双中心键级用其中选项1。我 ...

我是想只在我得出的三中心轨道上分析其中两个原子之间的键级,而不是基于所有轨道电子云的贡献

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发表于 Post on 2014-12-2 16:41:15 | 只看该作者 Only view this author
依然是用普通方式计算双中心键级,只不过除了三中心AdNDP轨道外的轨道占据数都设0就行了,不需要做别的。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2014-12-2 16:49:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2014-12-2 16:41
依然是用普通方式计算双中心键级,只不过除了三中心AdNDP轨道外的轨道占据数都设0就行了,不需要做别的。

谢谢您,我试试看!

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发表于 Post on 2015-4-11 21:36:51 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 goxiaoqian 于 2015-4-11 21:44 编辑
sobereva 发表于 2014-11-13 00:54
可以算多中心键级,见
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
http://hi.baidu.com/sobereva ...

请问,我最近用Multiwfn算了一个分子,得到HOMA值是0.99,可是多中心键级才等于0.075,这个数值能反映处芳香性强么?一般多中心键级越大,芳香性越强,但是多大才能说明芳香性强呢?

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发表于 Post on 2015-4-18 05:18:09 | 只看该作者 Only view this author
goxiaoqian 发表于 2015-4-11 21:36
请问,我最近用Multiwfn算了一个分子,得到HOMA值是0.99,可是多中心键级才等于0.075,这个数值能反映处 ...

0.075就已经很大了。不要看绝对值大小,数量级和一般观念不对应,应该和同级别下计算的苯的多中心键级对比。
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