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楼主 Author: 向往阳光
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[GROMACS] 关于拟合二面角项的两种做法的疑问

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发表于 Post on 2021-1-29 19:03:11 | 只看该作者 Only view this author
小潘潘 发表于 2021-1-27 21:34
老师我拟合的是六个单元的P3HT的二面角参数,后来我看别人的文章都是用的两个单元来拟合二面角角参数,后 ...

我暂时没时间仔细看
注意绝对不是单元数取得越多越好,因为单元数越多势能面越复杂、极小点越多。做柔性扫描时,其它变量都会被优化,单元数过多时其它地方的优化可能会导致额外的噪音出现,此时的势能面并不能充分单纯反映你关注的那个二面角的扭转势。
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发表于 Post on 2021-1-31 14:42:10 | 只看该作者 Only view this author
非常感谢老师的解答

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