lammps和gromacs聚合物建模的方法

Olive.Lv · 发表于 Post on 2023-12-15 16:54:11

Lacrimosa 发表于 2023-12-15 16:34
你输入topo就可以看到手册呀，里面明明写的是topo retypedihedrals

是的，是我没看仔细，后来改过来了

Olive.Lv · 发表于 Post on 2023-12-25 17:34:59

我用vmd给packmol建的模型附电荷，C原子我附的是6，因为用vmd打开其他优化好的文件，查C的电荷显示的是6，但是我今天在一篇文献中看到说石墨烯的电荷设为0，请问这是为什么？

youknowdcf · 发表于 Post on 2024-11-10 18:24:15

Olive.Lv 发表于 2023-12-25 17:34
我用vmd给packmol建的模型附电荷，C原子我附的是6，因为用vmd打开其他优化好的文件，查C的电荷显示的是6， ...

正常原始石墨烯的C都是不带电的LJ粒子

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