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楼主 Author: skyang
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[新手求助] MS2019年版的DMol3模块中,用COSMO-SAC方法计算Sigma-Profile,溶剂效应是啥意思?

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发表于 Post on 2022-12-4 16:35:56 | 只看该作者 Only view this author
克卜勒 发表于 2022-11-28 20:25
卡卡老师,这个里面的sigma-average开源软件计算出来的谱图和数据库里的不一样呢,纵坐标那里高了十倍左 ...

你好,MS怎么自己生成sigma-profile,是在dmol3里面是要勾选use solvation model吗,勾选的话dielectric constant是不是要自己设置值,想算纯物质的sigma profile。纯新手,看了好多相关的问题的回答,还是不太懂,看维吉尼亚理工的ppt因为版本不同各种东西都要改,而且找不到他们用的MS3.2的而资源毫无头绪。新版的MS又必须选溶剂,也没弄明白。如果可以指点一下的话不甚感激!

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发表于 Post on 2022-12-5 13:51:18 | 只看该作者 Only view this author
wdoen 发表于 2021-3-14 01:01
之所以会有溶剂选择的原因是他直接给你提供了对应溶剂的Dielectric constant值,这样你只要选择需要的溶剂 ...

如果要算纯组分的sigma profile, dielectric constant的值应该设为多少呢

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发表于 Post on 2022-12-5 13:53:44 | 只看该作者 Only view this author
skyang 发表于 2020-7-22 10:33
非常感谢回复。获益良多,我再试试,不懂再次请教,再次感谢。

你好,你这个问题解决了吗,我也遇到了一样的问题,想算纯组分的sigma profile,但是模块里面的好像必选一个溶剂

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发表于 Post on 2023-1-2 09:45:11 | 只看该作者 Only view this author

你好,克卜勒老师,我看你再帖子中问过Dmol3自带的cosmo计算出来的sigma-profile 图和sigma-average开源软件计算出来的谱图的区别问题,请问你最后是怎么抉择的?是用Dmol3计算出的数据,还是自己修改sigma-average开源软件然后计算呢?

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发表于 Post on 2023-8-9 09:43:01 | 只看该作者 Only view this author
楼主您好,我想求一个COSMO计算的sigma-average开源软件(网上链接失效了),不甚感激

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发表于 Post on 2023-8-10 00:22:48 | 只看该作者 Only view this author
求助:为什么一点击这个就出现这样的错误。
The requested URL /Liu-2013/Liu-DB/Sigma-average_v2.txt was not found on this server.

202308100022394570..jpg (80.62 KB, 下载次数 Times of downloads: 6)

202308100022394570..jpg

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发表于 Post on 2023-8-10 00:24:26 | 只看该作者 Only view this author
1159042428 发表于 2023-8-10 00:22
求助:为什么一点击这个就出现这样的错误。
The requested URL /Liu-2013/Liu-DB/Sigma-average_v2.txt wa ...

这样的

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