求助关于drude力场

s99r · 发表于 Post on 2021-5-8 16:10:35

k64_cc 发表于 2021-5-8 12:39
GMX现在官方支持SCF方法，dual Langevin方法才需要那个特殊版本，但是用它殊为不智。NAMD和OpenMM欢迎你。
...

楼主您好，您的意思是gromacs官网最新版可以使用极化力场吗？

s99r · 发表于 Post on 2021-5-8 22:51:03

ys_song 发表于 2021-5-8 15:41
sobereva在3楼回复中给的链接里有适合各个软件的力场文件，包括gromacs的。

谢谢您的回复，sob老师的链接我之前看过，用了gromacs2019版本试过，但是选择力场和模型之后总是不运行。

k64_cc · 发表于 Post on 2021-5-9 13:52:59

s99r 发表于 2021-5-8 16:10
楼主您好，您的意思是gromacs官网最新版可以使用极化力场吗？

你用shell particle，原理上是可以跑的。但是并没有与其配套的参数文件，只能考虑手写。

s99r · 发表于 Post on 2021-5-10 09:09:00

k64_cc 发表于 2021-5-9 13:52
你用shell particle，原理上是可以跑的。但是并没有与其配套的参数文件，只能考虑手写。

非常感谢

木贞 · 发表于 Post on 2023-2-6 16:59:12

k64_cc 发表于 2021-5-8 12:39
GMX现在官方支持SCF方法，dual Langevin方法才需要那个特殊版本，但是用它殊为不智。NAMD和OpenMM欢迎你。
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请问Gromacs支持的SCF方法怎么实现呢，有没有相关链接学习一下

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