CP2K-7.1编译出错：vdwxc_init_mpi - not found

haibeih · 发表于 Post on 2020-11-12 17:02:11

gog 发表于 2020-11-11 16:34
谢谢各位大神。编译成功，没有plumed组件。该是够用了。
介绍下编译环境：
redhat 7，mkl-2020.4，devtoo ...

谢谢你提供的数据，祝科研顺利！

flwboka · 发表于 Post on 2020-11-13 09:39:00

似乎conda里面已经有7.1版的cp2k了 https://anaconda.org/conda-forge/cp2k

gog · 发表于 Post on 2020-11-13 20:43:17

本帖最后由 gog 于 2020-11-15 09:11 编辑

flwboka 发表于 2020-11-13 09:39
似乎conda里面已经有7.1版的cp2k了 https://anaconda.org/conda-forge/cp2k

是用gnu+openblas+scalapcak编译的。centos 7上默认安装6.1。据此推，centos 8上，该是7.1版本。
喜欢用mkl的，咋办？

bblovelp · 发表于 Post on 2020-11-15 19:26:41

nicheal 发表于 2020-9-5 19:56
如果所有的测试都失败，通常不是cp2k的问题，你看看是不是在root下面运行的啊，如果是，openmpi在root下运 ...

您好我参考https://www.bilibili.com/read/cv7375723 CP2K也编译好了，第一次运行也成功了，重启后再次测试就出现所有测试全部失败，请问下您遇到过这种情况吗？

gog · 发表于 Post on 2020-11-16 21:40:02

bblovelp 发表于 2020-11-15 19:26
您好我参考https://www.bilibili.com/read/cv7375723 CP2K也编译好了，第一次运行也成功了，重启后再 ...

不建议在root用户下安装。自行编译好openmpi和cmake，普通用户权限下toolchain安装

bblovelp · 发表于 Post on 2020-11-18 21:31:36

gog 发表于 2020-11-16 21:40
不建议在root用户下安装。自行编译好openmpi和cmake，普通用户权限下toolchain安装

好的，我明天试下，感谢您了

Siling_S · 发表于 Post on 2020-11-28 19:20:21

haibeih 发表于 2020-9-15 11:02
官网推荐的9.3~另外也建议用Centos7吧，Centos8目前编译出来还是有些错误

我编译的时候用的是9.3.1，这个版本可以吗？主要是不太清楚官网指的9.3是否包括9.3.1.。。

haibeih · 发表于 Post on 2020-11-29 09:20:06

Siling_S 发表于 2020-11-28 19:20
我编译的时候用的是9.3.1，这个版本可以吗？主要是不太清楚官网指的9.3是否包括9.3.1.。。

你可以试试，但是如果报错的话，记得有可能是编译器的错误~

Siling_S · 发表于 Post on 2020-11-29 15:33:40

haibeih 发表于 2020-11-29 09:20
你可以试试，但是如果报错的话，记得有可能是编译器的错误~

在编译的时候，cmake一直会有error.log文件，然后sirius编译应该是需要依赖cmake，也会有error.log文件，最终CP2K的编译会报错，原因可能是sirius编译有问题，我换一下gcc试试吧~多谢指点

haibeih · 发表于 Post on 2020-11-30 08:53:05

另外，也可能和系统版本有关系，我用centos7就一遍过，test run一个问题都没有~但是centos8就会有不少问题（比如我就是编译不过sirius，所以就没装它）。估计Ubuntu系统也会有类似问题。

所以系统和编译器版本等的兼容性是cp2k编译的最大问题，编译流程跟着教程学就好，没什么问题。

gog · 发表于 Post on 2020-12-11 17:29:25

美式加糖发表于 2020-9-17 16:15
你好。我这里的报错是在最后cp2k编译阶段，我设置了mkl2015版，但是最后不知为何会去调用atlas-math。atl ...

centos 7默认版本python 2.7.* 安装好就可以。

gog · 发表于 Post on 2020-12-11 17:33:36

Siling_S 发表于 2020-11-29 15:33
在编译的时候，cmake一直会有error.log文件，然后sirius编译应该是需要依赖cmake，也会有error.log文件， ...

cmake自己编译，报错的可能性很高。直接下载官网3.18版本的二进制可执行版本，设置好路径就成了。3.18.4最好，测试全部通过，3.18.5，几千个测试算例，有四五个报错。

Siling_S · 发表于 Post on 2020-12-16 10:50:08

gog 发表于 2020-12-11 17:33
cmake自己编译，报错的可能性很高。直接下载官网3.18版本的二进制可执行版本，设置好路径就成了。3.18.4 ...

后来参考了b站的一个回复只编译了popt就成功了，再单独编译psmp还是不成，一样的报错，可能是某个前置文件的问题，linux了解的很浅找不到问题，只能先用popt练练了，感谢楼主交流~

gog · 发表于 Post on 2020-12-18 21:25:10

Siling_S 发表于 2020-12-16 10:50
后来参考了b站的一个回复只编译了popt就成功了，再单独编译psmp还是不成，一样的报错，可能是某个前置文 ...

实在是没法的话，就用gcc和gnu用默认数学库编译，能满足早期学习需求，足够了。

leeru · 发表于 Post on 2020-12-19 19:55:58

我个人感觉，cp2k 编译sirius进行纯平面波计算没啥优势，直接用qe不香吗?如果不好好利用高斯平面波的特点，用cp2k就是多此一举。

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