求助请问gromacs支持compass力场么

lqhenwunai · 发表于 Post on 2020-9-1 10:08:00

请问一下，gromacs支持compass力场么？从函数形式上看不支持。

如果我想修改gromacs函数形式，是不是只需要在相应cpp文件里添加函数，然后在top里声明func.type 就可以了？（感觉源码里函数调用关系挺复杂的）

ABetaCarw · 发表于 Post on 2020-9-1 10:53:25

MS独占加密的

naoki · 发表于 Post on 2020-9-1 14:24:08

除了MS，还有lammps支持参数不全的COMPASS力场。gromacs除了势函数不支持，主要还是COMPASS的参数搞不到

lqhenwunai · 发表于 Post on 2020-9-2 09:24:29

ABetaCarw 发表于 2020-9-1 10:53
MS独占加密的

谢谢。

lqhenwunai · 发表于 Post on 2020-9-2 09:24:33

naoki 发表于 2020-9-1 14:24
除了MS，还有lammps支持参数不全的COMPASS力场。gromacs除了势函数不支持，主要还是COMPASS的参数搞不到

谢谢。

bobosiji · 发表于 Post on 2020-9-2 15:22:36

naoki 发表于 2020-9-1 14:24
除了MS，还有lammps支持参数不全的COMPASS力场。gromacs除了势函数不支持，主要还是COMPASS的参数搞不到

COMPASS参数只能模拟有机物么？比模拟有机物的主流免费力场opls，amber，charmm如何？能否一战？

naoki · 发表于 Post on 2020-9-2 16:12:30

bobosiji 发表于 2020-9-2 15:22
COMPASS参数只能模拟有机物么？比模拟有机物的主流免费力场opls，amber，charmm如何？能否一战？

COMPASS能模拟有机无机分子以及聚合物和一些固体材料，普适性很强。其他几个力场的适用范围和COMPASS比还是略窄。因为只能在MS里用，实际使用中和其他力场的比较我也不知道，但你可以看看COMPASS的两篇原文。

bobosiji · 发表于 Post on 2020-9-2 20:10:59

naoki 发表于 2020-9-2 16:12
COMPASS能模拟有机无机分子以及聚合物和一些固体材料，普适性很强。其他几个力场的适用范围和COMPASS比还 ...

若真有人比较compass与其他力场，而且发文章；会被MS公司禁止使用MS不？

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