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楼主 Author: mt13
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[量化理论] 求助过渡金属配合物的计算采用什么泛函更好?

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发表于 Post on 2020-11-30 10:09:02 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-9-5 02:28
简谈量子化学计算中DFT泛函的选择
http://sobereva.com/272(http://bbs.keinsci.com/thread-536-1-1.html ...

老师,我探究的是卟啉中心引入不同的金属原子对器件性能的影响。涉及的都是过渡金属,比如锌,铜,铂,钯等。因为计算之前需要进行泛函与基组的筛选,如果按照HF含量,选择B3LYP,PBE0,PBE38,M06-2x等已经不适用。想请问老师,对于这样的主要想探究中心金属影响的体系,筛选泛函时,应该按照什么进行筛选,选择哪些泛函计算对比更合适?辛苦老师了

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发表于 Post on 2020-11-30 12:11:46 | 只看该作者 Only view this author
xxzj 发表于 2020-11-30 10:09
老师,我探究的是卟啉中心引入不同的金属原子对器件性能的影响。涉及的都是过渡金属,比如锌,铜,铂,钯 ...

这种非常普通的体系根本没必要做什么所谓的“筛选”
谈谈量子化学研究中什么样的benchmark才有意义
http://sobereva.com/554http://bbs.keinsci.com/thread-17826-1-1.html
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发表于 Post on 2020-11-30 18:51:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-30 12:11
这种非常普通的体系根本没必要做什么所谓的“筛选”
谈谈量子化学研究中什么样的benchmark才有意义
htt ...

老师,我看实验文章都选择的是B3LYP,然后我研究重点在于卟啉中心金属原子变化带来的影响上。涉及到不同的过渡金属,我选择和实验上一样的BTLYP会受到质疑吗?还是从SCAN、TPSSh、BP86、B97-1、PBE0、MN15L这些泛函中重新选择。谢谢老师

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发表于 Post on 2020-12-1 16:23:30 | 只看该作者 Only view this author
xxzj 发表于 2020-11-30 18:51
老师,我看实验文章都选择的是B3LYP,然后我研究重点在于卟啉中心金属原子变化带来的影响上。涉及到不同 ...

没有叫BTLYP的泛函,“和实验上一样”语义不明,做实验和泛函毫无联系

一般先考虑PBE0,无论是对于描述配合物体系,还是对于电子激发问题计算,都是如此。
如果有其它特殊情况,说明具体研究什么问题
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发表于 Post on 2020-12-1 18:40:18 | 只看该作者 Only view this author
xxzj 发表于 2020-11-30 18:51
老师,我看实验文章都选择的是B3LYP,然后我研究重点在于卟啉中心金属原子变化带来的影响上。涉及到不同 ...

如果金属是闭壳层,且没有强相关,选PBE0。
如果涉及开壳层金属,或者有强相关(比如金属离子的氧化性或者还原性比较强),可能需要具体问题具体分析,保险起见最好查一下文献计算类似的体系一般用什么泛函,注意只能找那些已经和实验或者高精度理论计算结果对比过,由此证明了计算结果可靠的文章。个人经验,TPSSh适合算铁,BP86适合算钴
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发表于 Post on 2020-12-1 20:41:27 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-12-1 18:40
如果金属是闭壳层,且没有强相关,选PBE0。
如果涉及开壳层金属,或者有强相关(比如金属离子的氧化性或 ...

嗯呢,知道啦,谢谢老师

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发表于 Post on 2024-9-3 22:17:00 | 只看该作者 Only view this author
双黄蛋 发表于 2020-10-25 00:20
你好,我也有同样的问题。我是做单茂稀土金属配合物引发烯烃聚合的。本人领域内有一位专门做计算的教授,看 ...

我也接触过与他们课题组相关的计算。对于你的疑问,我的看法如下:
首先,他们所谓的稀土大部分体系都是Sc(III)或Y(III),没有什么特别的电子结构,本身对泛函和基组都不敏感。对于这类体系,早期他们就哪个与实验(一般为晶体数据,少数有实验测定的活化能数据)对上就用哪个,后期就直接原封不动地沿用该方法。至于M06算单点那更是从US的某大名家照搬的。
Si用赝势基组是早期(2005-2010年代)为了成本或者算力考虑设置的,但现在其计算水准并没有与时俱进。侥幸的是,在该类体系中,Si用赝势处理与否,宏观上结果并没有显著差别。
用Mulliken电荷比较金属中心的电子性质,说明他们除此并没有什么可以掌握的有效分析手段。如今的Multiwfn有各种各样的物理意义明确的分析手段,相比粗暴的电荷比较不能合理太多。
最后,他一家独大是因为他背后有固定的实验合作者作为靠山,而并不取决于他本人的计算化学造诣如何。
总之泛函和基组的选择不能违背基本原理,也不可迷信“权威”照搬已发表文献所采用的方法。
反正我选择泛函基本只需参照Sob老师的文章http://sobereva.com/272

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发表于 Post on 2024-9-4 09:33:16 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-12-1 18:40
如果金属是闭壳层,且没有强相关,选PBE0。
如果涉及开壳层金属,或者有强相关(比如金属离子的氧化性或 ...

老师,如果算铜,除了常用的PBE0和TPSSh,根据您的经验哪个泛函好一些?谢谢

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发表于 Post on 2024-9-7 15:14:24 | 只看该作者 Only view this author
ABQTrap 发表于 2024-9-4 02:33
老师,如果算铜,除了常用的PBE0和TPSSh,根据您的经验哪个泛函好一些?谢谢

和价态关系很大,Cu(I)、Cu(II)、Cu(III)最优泛函很不一样。一般还是自己查类似配合物的文献比较可靠
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员

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