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[Amber] tinker-to-amber程序的运用

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楼主
请问tinker-to-amber这个程序是在amber程序中,还是在tinker程序中。有没有相关教程,找了好久都找不到。

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发表于 Post on 2015-10-17 23:13:51 | 只看该作者 Only view this author
Ambertools包里面有这个,对于我手头的Ambertools14,在src/etc/tinker_to_amber.F90
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-10-18 10:23:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-10-17 23:13
Ambertools包里面有这个,对于我手头的Ambertools14,在src/etc/tinker_to_amber.F90

谢谢sob老师,我找到了这个包,不知道怎么运用。 我用ifort运行这个文件出现以下问题,不知道这个文件怎么运用,谢谢sob老师指点。
@cac0 ~]$ ifort tinker_to_amber.f90
/tmp/ifort26a88R.o: In function `amoeba_parm_mp_am_parm_get_tortor_params_':
tinker_to_amber.f90:(.text+0x1538e): undefined reference to `isplpe_'
tinker_to_amber.f90:(.text+0x15698): undefined reference to `isplpe_'
tinker_to_amber.f90:(.text+0x159b7): undefined reference to `isplpe_'
/tmp/ifort26a88R.o: In function `amoeba_parm_mp_am_parm_tortorspline_':
tinker_to_amber.f90:(.text+0x31338): undefined reference to `isplpe_'
tinker_to_amber.f90:(.text+0x315f1): undefined reference to `isplpe_'
/tmp/ifort26a88R.o:tinker_to_amber.f90:(.text+0x318f2): more undefined references to `isplpe_' follow

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发表于 Post on 2015-10-18 18:04:41 | 只看该作者 Only view this author
我并没用过这个程序,看手册吧
不要单独编译它,ambertools编译过程中会顺带着编译它,编译完了之后就会产生在AmberTools/bin目录下
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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