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楼主 Author: sobereva
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[综合交流] 一篇文章深入揭示外电场对18碳环的超强调控作用

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发表于 Post on 2023-4-28 17:01:50 | 只看该作者 Only view this author
sobl老师好!请问一下,您所说的“化学键的相对长短也通过对键进行着色以直观地体现”,能不能稍微具体一些?谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-4-30 03:01:04 | 只看该作者 Only view this author
debai 发表于 2023-4-28 17:01
sobl老师好!请问一下,您所说的“化学键的相对长短也通过对键进行着色以直观地体现”,能不能稍微具体一些 ...

说清楚还要“具体”什么
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-5-3 17:25:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-4-30 03:01
说清楚还要“具体”什么

不好意思呀本人不懂的太多了。就是想让老师讲一下用什么软件,怎么设置不同长短的键颜色不同?谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-3 18:02:22 | 只看该作者 Only view this author
debai 发表于 2023-5-3 17:25
不好意思呀本人不懂的太多了。就是想让老师讲一下用什么软件,怎么设置不同长短的键颜色不同?谢谢!

北京科音基础量子化学培训班里讲了,用GaussView 6


北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2023-5-5 09:54:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-3 18:02
北京科音基础量子化学培训班里讲了,用GaussView 6

谢谢!一直想去参加这样的培训班,时间老错不开。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-5 22:25:04 | 只看该作者 Only view this author
debai 发表于 2023-5-5 09:54
谢谢!一直想去参加这样的培训班,时间老错不开。

下一次是今年8月20-25日,暑假一般都有时间
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发表于 Post on 2023-5-8 16:50:38 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-5 22:25
下一次是今年8月20-25日,暑假一般都有时间

不好意思,再请教一个问题。先说说想法,就是比较加电场后键长变化的直观体现,比如用不同颜色表示变长或变短。就好比是比较加场后电子密度变化的直观显示那样。不知道老师有没有这样的软件或multiwfn有没有这样的功能?感谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-8 22:28:33 | 只看该作者 Only view this author
debai 发表于 2023-5-8 16:50
不好意思,再请教一个问题。先说说想法,就是比较加电场后键长变化的直观体现,比如用不同颜色表示变长或 ...

参考下文。把键长改变量写入文件,用gview着色

将Multiwfn计算的键级直接标注在分子结构图上的方法
http://sobereva.com/523http://bbs.keinsci.com/thread-15658-1-1.html
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发表于 Post on 2023-5-13 18:13:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-5-8 22:28
参考下文。把键长改变量写入文件,用gview着色

将Multiwfn计算的键级直接标注在分子结构图上的方法

不好意思呀,键级的标注会跟着您的方法做,可您说的把键长改变量写入文件,还是不清楚具体的操作,是把每个键长的改变量算一下,把程序算的键级换成算的键长差吗?谢谢!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-5-13 23:05:56 | 只看该作者 Only view this author
debai 发表于 2023-5-13 18:13
不好意思呀,键级的标注会跟着您的方法做,可您说的把键长改变量写入文件,还是不清楚具体的操作,是把每 ...

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发表于 Post on 2023-6-12 10:33:30 | 只看该作者 Only view this author
社长好!我是orca使用新手,想请教一下orca可不可以将电场施加位局域电场,或者是空间中渐变的。比如某个比较大的分子在局域上施加电场,只对其某个基团产生主要影响。不知道这种能不能做?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-12 10:44:41 | 只看该作者 Only view this author
QEQEIop 发表于 2023-6-12 10:33
社长好!我是orca使用新手,想请教一下orca可不可以将电场施加位局域电场,或者是空间中渐变的。比如某个比 ...

不能
CP2K倒是可以,允许你提供一个格点数据文件,里面定义各个格点上的外加静电势,静电势的梯度对应电场。这样的格点数据文件可以自己写个程序根据实际要求产生。
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发表于 Post on 2023-6-12 11:53:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-12 10:44
不能
CP2K倒是可以,允许你提供一个格点数据文件,里面定义各个格点上的外加静电势,静电势的梯度对应电 ...

谢谢社长!我记得QE也可以加局域电场。您能否给个建议,如果我要算局域电场对分子的影响,用QE和CP2K哪个会比较容易,以及结果的话哪个可能更靠谱?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-6-13 11:48:52 | 只看该作者 Only view this author
QEQEIop 发表于 2023-6-12 11:53
谢谢社长!我记得QE也可以加局域电场。您能否给个建议,如果我要算局域电场对分子的影响,用QE和CP2K哪个 ...

QE我不评论
CP2K结合Multiwfn使用很容易,可靠性毫无问题
使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文件
http://sobereva.com/587http://bbs.keinsci.com/thread-21668-1-1.html

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发表于 Post on 2023-6-14 11:37:57 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2023-6-13 11:48
QE我不评论
CP2K结合Multiwfn使用很容易,可靠性毫无问题
使用Multiwfn非常便利地创建CP2K程序的输入文 ...

超级感谢!我去玩玩试试!

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